国际癌症基因组联盟数据集
国际癌症基因组联盟（ICGC）数据集是一个全球性癌症多组学数据资源，包含基因组、转录组、表观基因组等多模态分子数据，通过大规模测序技术构建。该数据集主要用于癌症驱动基因识别、分子亚型分析、生物标志物发现及精准医疗研究，支持研究人员深入探索癌症的遗传机制并推动临床转化应用。
基本信息
资源简介
国际癌症基因组联盟数据集
【一句话概览】
ICGC Data Portal 已于 2024 年 6 月正式关闭，官方感谢所有参与者的付出与贡献。交互式网页门户虽已停用，但最新发布版本与 PCAWG 数据仍向授权用户开放；ICGC 25K 数据的获取方式可查阅相关数据访问文档。ICGC ARGO 项目是国际癌症基因组联盟的新阶段，旨在将基因组知识转化为改善癌症患者结局的新方法。如有疑问可联系 ICGC ARGO Helpdesk（来源 dcc.icgc.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《ICGC Data Portal》。
【数据内容】
源站原始描述：ICGC Data Portal The ICGC Data Portal officially closed in June, 2024 We sincerely thank all involved for your dedication, passion, and contributions. While the interactive web portal has been decommissioned, the most recent release and PCAWG data remain available for authorized users. For information on accessing ICGC 25K data, see the documentation for ICGC 25K Data Access . The Accelerating Research in Genomic Oncology (ICGC ARGO) project is a new phase of the International Cancer Genome Cons…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：ICGC数据门户 ICGC数据门户已于2024年6月正式关闭。我们衷心感谢所有参与者的奉献、热情与贡献。虽然交互式网页门户已退役，但最新发布的数据及PCAWG数据仍对授权用户开放。有关访问ICGC 25K数据的信息，请参阅ICGC 25K数据访问文档。加速基因组肿瘤学研究（ICGC ARGO）项目是国际癌症基因组联盟的新阶段，旨在将基因组知识转化为改善癌症患者预后的新方法。更多信息请访问www.icgc-argo.org。如有任何疑问，请联系ICGC ARGO帮助台。© 2024国际癌症基因组联盟。版权所有。
【主题与分类】
主题标签：ICGC、PCAWG、ICGC 25K、ICGC ARGO、cancer genomics。
【获取与许可】
源站页面：https://dcc.icgc.org/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
国际癌症基因组联盟（ICGC）是一个专注于癌症基因组学研究的国际合作项目，旨在通过多组学方法解析癌症的遗传基础。该数据集包含来自全球多个研究中心的癌症患者基因组、转录组、表观基因组等多模态数据，数据通过大规模测序和生物信息学分析构建。ICGC数据门户网站虽已于2024年6月关闭，但其最新发布的数据和泛癌分析工作组（PCAWG）数据仍对授权用户开放，主要用于癌症驱动基因发现、分子亚型鉴定、生物标志物开发及精准医疗研究。ICGC的新阶段——加速基因组肿瘤学研究（ICGC ARGO）项目正在推进，致力于将基因组学知识转化为改善癌症患者预后的临床方法。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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