GSE53622食管鳞癌独立验证队列
肿瘤领域表格公开数据集，来源：ncbi。
基本信息
资源简介
GSE53622食管鳞癌独立验证队列
【数据集背景】
本数据集源站标题为《LncRNA profile study reveals a three-lncRNA signature associated with the survival of esophageal squamous cell carcinoma patients (independent set)》。源站首次发布：Dec 23 201。
【数据内容】
源站原始描述：Objective: Globally, esophageal cancer is among the most deadly cancer forms. Long non-coding RNAs (lncRNA) are frequently found to have important regulatory roles. We aim to assess the lncRNA expression profile of esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) and identify prognosis related lncRNAs. Design: LncRNA expression profiles were studied by microarray in paired tumor and normal tissues from 119 ESCC patients, and validated by qRT-PCR. The 119 patients were subsequently divided randomly into…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL18109、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53622
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 31 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE53622
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE53622 是食管鳞癌 lncRNA 表达谱独立验证队列，包含 60 例患者的配对样本，可用于预后模型验证。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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