GSE27929：Kap1 基因组招募的功能分析
数据通过高通量测序对多种突变 KAP1 蛋白进行 ChIP-seq，用于研究 KAP1 的基因组招募机制。源站描述指出，当前模型认为 KAP1 通过与含 KRAB 结构域的锌指转录因子相互作用实现招募，实验显示该机制仅介导 KAP1 结合到锌指基因的 3' 端，而其他因子参与将 KAP1 招募到启动
基本信息
资源简介
GSE27929：Kap1 基因组招募的功能分析
Functional analysis of Kap1 genomic recruitment
该数据集来自 NCBI GEO，标题为 Functional analysis of Kap1 genomic recruitment，属于肿瘤 / 上皮样肉瘤分类。数据通过高通量测序对多种突变 KAP1 蛋白进行 ChIP-seq，用于研究 KAP1 的基因组招募机制。源站描述指出，当前模型认为 KAP1 通过与含 KRAB 结构域的锌指转录因子相互作用实现招募，实验显示该机制仅介导 KAP1 结合到锌指基因的 3' 端，而其他因子参与将 KAP1 招募到启动子区域。数据集含 1 个文件，样例为 GSE27929_series_matrix.txt.gz，作者为 Sushma，Iyengar，发布时间为 Mar 14 201（来源。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 14 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目前关于 Kap1 基因组招募的一个模型是通过其与含 KRAB 结构域的锌指转录因子的相互作用实现的。我们对多种突变 KAP1 蛋白进行了 ChIP-seq，结果表明该招募机制仅介导 KAP1 结合到锌指基因的 3' 端，而其他因子参与将 KAP1 招募到启动子区域。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL9052、9606。本站分类：肿瘤/上皮样肉瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27929
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27929
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目前关于Kap1基因组招募的模型是通过其与含KRAB结构域的锌指转录因子的相互作用。我们针对多种突变型KAP1蛋白进行了ChIP-seq分析，结果显示这一招募机制仅介导KAP1结合至锌指基因的3’端，而其他因子则参与将KAP1招募至启动子区域。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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