CD109调控上皮样肉瘤癌干样细胞表达数据
基于ESX上皮样肉瘤细胞系ALDH高低亚群的基因表达数据，用于研究癌干样细胞标志物。由European Bioinformatics Institute提供，来自ArrayExpress，数据格式为表格，适用于分类任务。
基本信息
资源简介
CD109调控上皮样肉瘤癌干样细胞表达数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《CD109 expression regulates the phenotype of cancer stem-like cells or cancer-initiating cells in epithelioid sarcoma with possible impact on clinical prognosis》。
【数据内容】
源站原始描述：Several human cancers contain a small subpopulation of cells called cancer stem-like cells (CSCs)/cancer initiating cells (CICs), which are defined by the ability of self- renewal, multi-differentiation potential, and tumorigenesis. In current study, we focused on epithelioid sarcoma, which is very rare caner, and isolated CSCs/CICs from epitheloid sarcoma cell line ESX based on ALDH activity using ALDEFLUOR assay towards identification of a new CIC/CSC marker. We performed gene profiling betwee…
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-MEXP-3826
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-MEXP-3826
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
基于ESX上皮样肉瘤细胞系ALDH高低亚群的基因表达数据，用于研究癌干样细胞标志物。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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