室管膜瘤全基因组甲基化数据集
包含83例室管膜瘤Illumina 450K DNA甲基化芯片数据,可用于甲基化分型和表观遗传分析。由National Cancer Center Japan提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
室管膜瘤全基因组甲基化数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-wide methylation analysis of ependymoma using Infinium HumanMethylation 450 BeadChip》。源站首次发布:May 16 201。
【数据内容】
源站原始描述:Genome wide DNA methylation profiling of ependymomas. The Illumina Infinium 450k Human DNA methylation Beadchip was used to obtain DNA methylation profiles across approximately 485,500 CpGs. Samples included 83 ependymomas
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Methylation profiling by genome tiling array、GPL13534、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE114523
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 14 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE114523
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含83例室管膜瘤Illumina 450K DNA甲基化芯片数据,可用于甲基化分型和表观遗传分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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