室管膜瘤亚群谱系与临床分类及预后关系数据集（单细胞RNA测序数据）
该数据集是一个基于单细胞RNA测序技术的室管膜瘤研究数据，包含从患者肿瘤样本中鉴定出的四种细胞亚群（CEC、TEC、UEC、MEC）的基因表达谱。数据模态为单细胞转录组数据，主要用于揭示室管膜瘤的肿瘤内细胞异质性、亚群谱系分化轨迹、亚群比例与临床分类及患者预后的关联，以及肿瘤在初诊和复发过程中的动态演变，为理解该脑肿瘤的生物学机制和开发精准治疗策略提供重要依据。
基本信息
资源简介
室管膜瘤亚群谱系与临床分类及预后关系数据集（单细胞RNA测序数据）
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Ependymoma subpopulation lineages underlie clinical classification and outcome (scRNAseq data set)》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Ependymoma (EPN) is a brain tumor commonly presenting in childhood that remains fatal in the majority of children. Intra-tumoral cellular heterogeneity in bulk tumor samples significantly confounds our understanding of EPN biology, impeding development of effective therapy. We used single-cell RNA sequencing to identify four neoplastic cell subpopulations in posterior fossa EPN patient samples that underlie traditional subgroup classification and harbor divergent lineage trajectories and clinica…
【主题与分类】
主题标签：RNA-seq、classification、ependymomasc、etiology.、RNA-seq、classification、ependymomasc、etiology.、人、Ependymoma。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=c367a06b092a48fe4e5b27d89d880d38
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 32783945
下载信息
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数据集获取
源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=c367a06b092a48fe4e5b27d89d880d38
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对儿童常见且致死率高的脑肿瘤——室管膜瘤（EPN）的单细胞RNA测序数据集。数据来源于后颅窝室管膜瘤患者样本，通过单细胞测序技术识别出四种肿瘤细胞亚群：纤毛型室管膜瘤细胞（CEC）、转运型室管膜瘤细胞（TEC）、未分化型室管膜瘤细胞（UEC）和间充质型室管膜瘤细胞（MEC）。研究揭示了这些亚群的比例决定了传统PFA亚型的分类，并具有不同的谱系轨迹和临床预后。数据可用于分析肿瘤内细胞异质性、亚群动态演变（如初诊与复发间的变化）、以及各亚群与患者生存期的关联（例如UEC和MEC比例高与较短生存期相关，CEC与较长生存期相关）。该数据集为理解室管膜瘤的肿瘤生物学、细胞起源及开发靶向疗法提供了重要基础。
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