儿童脑肿瘤图谱
肿瘤领域多模态公开数据集，来源：d3b.center。
基本信息
资源简介
儿童脑肿瘤图谱
【一句话概览】
D3b中心的旗舰研究项目是儿童脑肿瘤网络（CBTN），前身为儿童脑肿瘤组织联盟（CBTTC），是一个致力于儿童脑肿瘤研究与治疗的多机构合作研究项目。D3b团队担任CBTN的运营中心。CBTN支持儿童脑肿瘤新预后生物标志物和疗法的研究，由横跨四大洲的数十家顶级儿科研究机构组成，已招募数千名儿童研究受试者，自成立以来收集了超过6万管标本。这些标本均经过高度注释，并配有纵向临床数据、基因组数据、影像数据和组织学数据，可供全球研究人员申请使用。2018年9月，CBTN推出了儿童脑肿瘤图谱（PBTA）（来源 d3b.center）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Children''s Brain Tumor Network (CBTN)》。
【数据内容】
源站原始描述：The D3b Center''s pioneering research project is the Children''s Brain Tumor Network (CBTN), previously known as the Children''s Brain Tumor Tissue Consortium (CBTTC), a collaborative, multi-institutional research program dedicated to the study and treatment of childhood brain tumors. The D3b team is proud to function as the CBTN''s Operations Center under the leadership of Co-Executive Chairs Brian Rood, MD, of Children''s National Hospital along with Angela Waanders, MD, MPH, of Ann & Robert H. Lur…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：D3b中心的开创性研究项目是儿童脑肿瘤网络（CBTN），前身为儿童脑肿瘤组织联盟（CBTTC），这是一个致力于儿童脑肿瘤研究与治疗的多机构合作研究项目。D3b团队自豪地作为CBTN的运营中心，在联合执行主席——来自国家儿童医院的Brian Rood医学博士和芝加哥安与罗伯特·H·卢里儿童医院的Angela Waanders医学博士、公共卫生硕士——以及联合科学主席——加州大学旧金山分校贝尼奥夫儿童医院的Michael Prados医学博士和密歇根大学医学院C.S. Mott儿童医院的Carl Koschmann医学博士——的领导下开展工作。费城儿童医院D3b中心联合主任Adam Resnick博士担任CBTN的科学主任。CBTN支持针对儿童脑肿瘤患者的新预后生物标志物和疗法的研究。这项合作研究努力由遍布四大洲的数十家顶级儿科研究机构组成的网络构成，自成立以来已招募数千名儿童研究受试者，收集了超过60,000管标本。这些标本采集均经过高度注释，并与纵向临床数据、基因组数据、影像数据和组织学数据配对，可供全球研究人员申请使用。2018年9月，CBTN启动了儿童脑肿瘤图谱（PBTA），这是世界上最大的可无限制获取的儿童脑肿瘤数据集之一。用户可以通过Gabriella Miller Kids First数据资源门户搜索PBTA文件及相关元数据。此外，用户还可以识别基因组及其他类型的文件，然后将其整合到Cavatica工作区中，以进一步研究原始基因组数据。PBTA数据摘要和数据可视化也可在PedcBioPortal上获取。研究人员可以通过填写并提交CBTN数据访问申请表来申请获取原始基因组数据。
【主题与分类】
主题标签：pediatric brain tumors、CBTN、PBTA、genomic data、imaging data、histology data、clinical data、biomarkers、Cavatica、Kids First Data Resource Portal。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://d3b.center/our-research/cbtn/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://d3b.center/our-research/cbtn/
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
PBTA 是 CBTN 发起的儿童脑肿瘤数据资源，包含基因组和临床元数据，可用于肿瘤分型研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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