全基因组CRISPR筛选鉴定多不饱和脂肪酸处理细胞中铁死亡敏感性的介导因子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130982

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多不饱和脂肪酸（PUFA）使细胞对铁死亡敏感。在与该数据集相关的研究中，我们使用UACC257作为模型细胞系（内在对铁死亡具有抗性），并通过不同的PUFA诱导其对铁死亡敏感。我们进行了全基因组CRISPR敲除筛选，以鉴定介导对ML210敏感性的基因，ML210是谷胱甘肽过氧化物酶4（GPX4）的选择性抑制剂，也是铁死亡的强效诱导剂。我们在其他基因中鉴定出细胞色素P450氧化还原酶（POR，CYPOR）是铁死亡所需的关键因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。