人源神经类器官模型用于弥漫性中线胶质瘤研究：真实再现患者肿瘤复杂性
该数据集构建了一个包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的可扩展人源神经类器官模型，用于模拟弥漫性中线胶质瘤（DMG）的复杂肿瘤微环境。数据集主要包含基于NanoString GeoMx空间转录组学技术获取的三株DMG PDX细胞系在该类器官中整合与相互作用的空间转录组图谱、混合细胞区域的特征分析数据，以及与真实患者样本的对比验证数据。其主要用途是为这种致命性儿童脑癌的疾病机制研究、药物筛选和临床前评估提供一个更贴近人体生理、可靠且经济的体外模型系统。
基本信息
资源简介
该数据集旨在为弥漫性中线胶质瘤（DMG）——一种极具侵袭性和致命性的儿童脑癌——提供一种新型、可靠的临床前研究模型。数据集的核心是构建一种可扩展的人源诱导多能干细胞（iPSC）来源的神经类器官系统，该系统包含神经元、功能性星形胶质细胞和小胶质细胞，模拟了肿瘤微环境（TME）的关键成分。研究利用NanoString GeoMx空间转录组学技术，对3种不同的DMG患者来源异种移植（PDX）细胞系在该神经类器官中的整合与相互作用进行了空间层面的转录组分析。数据内容涵盖肿瘤细胞与类器官内正常细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞）的空间相互作用图谱、混合细胞区域的转录组特征，以及模型与真实DMG患者活检样本在转录组和蛋白质组层面的对比验证数据。该数据集的主要应用方向包括：1）建立更贴近人体真实情况的DMG体外模型，克服传统小鼠模型（昂贵、技术挑战大）和单细胞培养模型（缺乏肿瘤微环境）的局限性；2）研究DMG肿瘤细胞在复杂微环境中的生物学行为及与宿主细胞的相互作用；3）为物种匹配的药物筛选和靶点验证，包括“旁观者毒性”评估，提供高效、经济的平台。
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源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.16915253
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数据说明
该数据集旨在为弥漫性中线胶质瘤（DMG）——一种极具侵袭性和致命性的儿童脑癌——提供一种新型、可靠的临床前研究模型。数据集的核心是构建一种可扩展的人源诱导多能干细胞（iPSC）来源的神经类器官系统，该系统包含神经元、功能性星形胶质细胞和小胶质细胞，模拟了肿瘤微环境（TME）的关键成分。研究利用NanoString GeoMx空间转录组学技术，对3种不同的DMG患者来源异种移植（PDX）细胞系在该神经类器官中的整合与相互作用进行了空间层面的转录组分析。数据内容涵盖肿瘤细胞与类器官内正常细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞）的空间相互作用图谱、混合细胞区域的转录组特征，以及模型与真实DMG患者活检样本在转录组和蛋白质组层面的对比验证数据。该数据集的主要应用方向包括：1）建立更贴近人体真实情况的DMG体外模型，克服传统小鼠模型（昂贵、技术挑战大）和单细胞培养模型（缺乏肿瘤微环境）的局限性；2）研究DMG肿瘤细胞在复杂微环境中的生物学行为及与宿主细胞的相互作用；3）为物种匹配的药物筛选和靶点验证，包括“旁观者毒性”评估，提供高效、经济的平台。
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