VUMC DLBCL PETAL 试验浅全基因组与靶向测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,收录 VUMC 的 DLBCL 样本,对应 PETAL 试验中接受治疗的弥漫性大B细胞淋巴瘤患者,包含浅全基因组测序与靶向测序数据

基本信息
资源简介
VUMC DLBCL PETAL 试验浅全基因组与靶向测序样本数据集
ena-DATASET-VUMC-CCA-30-11-2021-10:54:57:998-350 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤相关数据集,其分类归属于弥漫性大B细胞淋巴瘤。该数据集来源于 VUMC,样本对应 PETAL 试验中接受治疗的弥漫性大B细胞淋巴瘤患者,包含浅全基因组测序与靶向测序数据。从主题标签来看,该数据集属于 Genomics 范畴,主要面向基因组学层面的研究与应用。整体而言,该数据集围绕弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的测序数据展开,为相关研究提供了来自特定临床试验背景下的样本资源,适合关注该疾病分子特征、测序分析及肿瘤基因组学的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集对应的疾病领域为弥漫性大B细胞淋巴瘤,属于肿瘤相关分类。其样本与 PETAL 试验中接受治疗的弥漫性大B细胞淋巴瘤患者相关。PETAL 试验是该数据集的重要背景来源,说明这些样本并非来自一般性临床收集,而是与一项针对弥漫性大B细胞淋巴瘤患者治疗的试验相关联。数据集名称中包含 VUMC 标识,表明其来源机构为 VUMC。该数据集在 omicsdi.org 上发布,主题标签为 Genomics,说明其核心内容围绕基因组学数据展开。对于研究弥漫性大B细胞淋巴瘤的科研人员而言,该数据集提供了与特定临床试验相关的样本资源,有助于在基因组层面开展后续分析。
【数据内容】
该数据集包含浅全基因组测序与靶向测序数据。浅全基因组测序通常用于获取基因组范围内的低深度覆盖信息,而靶向测序则针对特定区域或基因进行更深入的测序分析。两者结合,可为弥漫性大B细胞淋巴瘤样本提供不同层面的基因组信息。数据集名称中包含“samples”字样,表明其内容以样本为单位组织。该数据集收录的是 VUMC 的弥漫性大B细胞淋巴瘤样本,样本对应 PETAL 试验中接受治疗的患者。除上述测序类型与样本来源外,源站未提供更详细的数据内容说明,例如具体样本数量、测序深度、靶向区域列表、数据文件格式等均未在现有信息中体现。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,来源站描述指出其为 PETAL 试验中接受治疗的弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的浅全基因组测序与靶向测序数据。数据集名称中包含 VUMC,表明样本或数据与 VUMC 相关。数据集英文名中还包含日期与时间信息“30-11-2021-10:54:57:998”,这可能与数据集的创建、提交或版本时间相关,但源站未提供该时间戳的具体含义说明。除上述来源信息外,源站未提供关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息、患者纳入排除标准等更多细节。
【适用场景】
基于其疾病分类与测序类型,该数据集适用于弥漫性大B细胞淋巴瘤相关的基因组学研究。具体而言,浅全基因组测序数据可用于分析基因组层面的拷贝数变化、结构变异或其他全基因组范围的特征;靶向测序数据可用于关注特定基因或区域的变异情况。由于样本与 PETAL 试验中接受治疗的患者相关,该数据集也可能适用于与治疗背景相关的探索性分析。主题标签为 Genomics,说明其适用场景主要集中在基因组学领域。除上述方向外,源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的用途说明。
【使用方法】
该数据集以样本为单位组织,名称中包含“samples”。使用者可根据自身研究需求,对浅全基因组测序数据与靶向测序数据分别或联合进行分析。由于数据集来源于 omicsdi.org,使用者可通过该平台获取相关数据入口。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具建议、参考基因组版本等信息,源站未提供。因此,在实际使用前,建议使用者结合 omicsdi.org 上的原始条目进一步确认数据组织方式与可用性。
【质量与限制】
该数据集来源于 omicsdi.org,并关联 VUMC 与 PETAL 试验,但其具体样本数量、测序质量指标、覆盖度、数据完整性、批次信息、质控标准等均未在现有信息中提供。数据集名称中包含日期与时间信息,但源站未说明其具体含义,因此无法据此判断数据版本或更新状态。该数据集分类为肿瘤 / 弥漫性大B细胞淋巴瘤,主题标签为 Genomics,但源站未提供关于数据质量评估、局限性说明或使用注意事项的更多内容。使用者在利用该数据集时,应自行评估其适用性与可靠性。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org,来源站描述提及 PETAL 试验。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应前往 omicsdi.org 查看原始条目,以获取准确的引用要求与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008386
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Shallow whole genome sequencing and targeted sequencing of DLBCL patients treated in the PETAL trial
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