GSE2553人类肉瘤表达谱数据集

包含181例人类骨与软组织肉瘤表达谱数据,其中含多例皮肤纤维肉瘤相关样本,可用于肉瘤分类和表达特征研究。由National Cancer Institute提供,来自NCBI GEO,数据格式为表格,专注于肿瘤领域的隆突性皮肤纤维肉瘤研究。

National Cancer InstituteNational Cancer Institute
NCBI GEO
2013-07-29 更新
浏览 49
表格分类Expression profiling by arrayGPL19779606
GSE2553 NHGRI Sarcoma Baird

基本信息

模态
表格
数据量
181
任务类型
分类
创建/更新时间
2013-07-29

资源简介

GSE2553人类肉瘤表达谱数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《NHGRI_Sarcoma_Baird》。源站首次发布:Apr 21 200。

【数据内容】

源站原始描述:Sarcomas are a biologically complex group of tumors of mesenchymal origin. By using gene expression microarray analysis, we aimed to find clues into the cellular differentiation and oncogenic pathways active in these tumors as well as potential biomarkers and therapeutic targets. We examined 181 tumors representing 16 classes of human bone and soft tissue sarcomas on a 12,601-feature cDNA microarray. Remarkably, 2,766 probes differentially expressed across this sample set clearly delineated the…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL1977、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2553

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 29 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2553

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含181例人类骨与软组织肉瘤表达谱数据,其中含多例皮肤纤维肉瘤相关样本,可用于肉瘤分类和表达特征研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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