TOX基因上调和下调调控的蕈样肉芽肿细胞RNA测序数据集
该数据集包含了在蕈样肉芽肿（皮肤T细胞淋巴瘤）Myla细胞系中，通过过表达和敲低技术调控TOX基因后，利用RNA测序技术获得的转录组数据，数据模态为基因表达谱（文本/数值型矩阵），主要用于研究TOX基因在皮肤T细胞淋巴瘤中的转录调控功能，及其对下游基因（如PRKAR2B）表达的影响，为理解疾病机制和发现潜在治疗靶点提供数据支持。
基本信息
资源简介
TOX基因上调和下调调控的蕈样肉芽肿细胞RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《RNAseq in TOX up- and down-regulated mycosis fungoides cells》。源站首次发布：2019-08-17。
【数据内容】
源站原始描述：We up-regulated (TOX vs G) and down-regulated (SH1&SH2 vs SHV) TOX expression in Myla cell line, and performed RNA sequencing to analyse TOX-related transcriptome differences in these cells. Over-expression and suppression of TOX led to mRNA regulation of multiple genes including PRKAR2B
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 177.72 MB。数据集 DOI：10.17632/b5d3w3hjyj.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/b5d3w3hjyj
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/b5d3w3hjyj
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个转录组学数据集，主要研究TOX基因在蕈样肉芽肿（一种皮肤T细胞淋巴瘤）细胞系（Myla细胞系）中的功能。通过使用TOX过表达（TOX vs G）和TOX敲低（SH1&SH2 vs SHV）两种方式调控TOX基因的表达，并进行RNA测序，以分析TOX表达水平变化所引起的转录组差异。数据揭示了TOX过表达和抑制导致包括PRKAR2B在内的多个基因的mRNA表达发生改变。这些数据可用于研究TOX基因在皮肤T细胞淋巴瘤发生发展中的作用机制，以及探索潜在的生物标志物或治疗靶点。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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