蕈样肉芽肿大细胞转化RNA测序数据集
包含MF大细胞转化和非大细胞转化皮肤活检样本及CTCL细胞系干预样本的RNA测序数据。由Peking University First Hospital提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含63条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的皮肤T细胞淋巴瘤研究。

基本信息
资源简介
蕈样肉芽肿大细胞转化RNA测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene expression profiling of mycosis fungoides with and without LCT as well as CTCL cell lines via PEG10 knockdown and overexpression by RNA-seq》。源站首次发布:Mar 08 202。
【数据内容】
源站原始描述:Mycosis fungoides (MF), the most common subtype of cutaneous T-cell lymphoma (CTCL), may undergo large-cell transformation (LCT), which is related to aggressive clinical courses and resistance to conventional treatments. However, the mechanisms of LCT remain largely unknown.We performed RNA-seq on biopsied specimens isolated from 26 MF-LCT patients and 23 MF-NLCT patients to decipher the mechanisms underlying LCT. We found PEG10 was overexpressed in MF-LCT compared with MF -NLCT cases. In order…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE168508
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 18 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE168508
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含MF大细胞转化和非大细胞转化皮肤活检样本及CTCL细胞系干预样本的RNA测序数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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