蕈样肉芽肿与Sézary综合征肿瘤基因组数据集

包含蕈样肉芽肿肿瘤样本的基因表达和阵列CGH数据,用于分析MF与Sézary综合征基因组差异。由Leiden University Medical Center提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含44条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的皮肤T细胞淋巴瘤研究。

Leiden University Medical CenterLeiden University Medical Center
Gene Expression Omnibus
2019-03-25 更新
浏览 35
表格分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE12902

基本信息

模态
表格
大小
0.123734426 GB
数据量
44
任务类型
分类
创建/更新时间
2019-03-25

资源简介

蕈样肉芽肿与Sézary综合征肿瘤基因组数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Oncogenomic analysis of mycosis fungoides reveals major differences with Sézary syndrome》。源站首次发布:Sep 23 200。

【数据内容】

源站原始描述:Mycosis fungoides (MF), the most common cutaneous T-cell lymphoma (CTCL), is a malignancy of mature, skin-homing T cells. Sézary syndrome (Sz) is often considered to represent a leukemic phase of MF. In this study the pattern of numerical chromosomal alterations in MF tumor samples was defined using array-based CGH; simultaneously gene expression was analyzed using microarrays. Highly recurrent chromosomal alterations in MF include copy number gain of 7q36, 7q21-7q22 and loss of 5q13 and 9p21. T…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL570、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE12902

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 25 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE12902

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含蕈样肉芽肿肿瘤样本的基因表达和阵列CGH数据,用于分析MF与Sézary综合征基因组差异。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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