造釉细胞型颅咽管瘤RNA测序数据

该数据集为造釉细胞型颅咽管瘤(ACP)的RNA测序数据,来源于omicsdi.org,属于肿瘤/颅咽管瘤分类。数据覆盖18例人类ACP样本、3例胎儿垂体及3例无功能垂体腺瘤,主题标签为转录组学

omicsdi
浏览 10
基因组分类Transcriptomics
RNA Sequencing of Adamantinomatous Craniopharyngioma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

造釉细胞型颅咽管瘤RNA测序数据

RNA Sequencing of Adamantinomatous Craniopharyngioma 是一个聚焦于造釉细胞型颅咽管瘤(adamantinomatous craniopharyngioma,ACP)的转录组学数据集,归属于肿瘤/颅咽管瘤分类,数据来源于 omicsdi.org。该数据集以 RNA 测序为核心技术手段,对人类 ACP 样本以及作为对照或参照的垂体相关组织进行了转录层面的刻画,主题标签为 Transcriptomics。从样本构成看,数据集覆盖 18 例人类 ACP 样本、3 例胎儿垂体以及 3 例无功能垂体腺瘤,共涉及三类生物学材料,为在转录组水平上观察 ACP 与胎儿垂体、无功能垂体腺瘤之间的表达特征差异提供了数据基础。整体而言,该数据集属于肿瘤转录组学范畴,适合围绕颅咽管瘤的分子特征开展探索性分析。

【数据集背景】

造釉细胞型颅咽管瘤是颅咽管瘤的一种亚型,属于颅内肿瘤研究关注的对象。该数据集以 ACP 为研究对象,采用 RNA 测序技术获取转录组信息,主题标签明确指向转录组学(Transcriptomics)。数据集英文名称直接体现了其研究对象与技术路线,即针对造釉细胞型颅咽管瘤的 RNA 测序。在分类体系上,该数据集被归入肿瘤 / 颅咽管瘤类别,说明其定位是肿瘤学背景下针对颅咽管瘤这一特定病种的分子数据资源。关于该数据集产生的具体研究背景、科学问题与项目立项信息,源站未提供。

【数据内容】

数据集的内容主体为 RNA 测序数据,覆盖三类样本:18 例人类 ACP 样本、3 例胎儿垂体、3 例无功能垂体腺瘤。其中 ACP 样本构成数据的主要部分,胎儿垂体与无功能垂体腺瘤则提供了不同来源的垂体相关组织参照。主题标签为转录组学,表明数据所承载的是转录层面的测量信息。关于测序平台、读长、数据类型(如原始读段或表达定量结果)、基因注释版本、样本分组细节以及是否包含临床或病理注释等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,在分类上属于肿瘤 / 颅咽管瘤。样本层面的事实为:18 例人类 ACP 样本、3 例胎儿垂体、3 例无功能垂体腺瘤。关于样本采集机构、采集时间、伦理审批、供体人口学信息、测序实验的具体操作流程以及数据提交与托管情况,源站未提供。

【适用场景】

基于其转录组学属性与样本构成,该数据集可用于围绕造釉细胞型颅咽管瘤的转录组特征开展分析,例如比较 ACP 样本与胎儿垂体、无功能垂体腺瘤之间的表达谱差异,探索 ACP 在转录层面的分子特点。由于同时包含胎儿垂体与无功能垂体腺瘤两类垂体相关材料,该数据集也适合用于涉及垂体组织参照的转录组比较研究。上述场景均属于基于数据集主题与样本构成的一般性用途说明;关于该数据集在原研究中实际支持的具体分析结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 RNA 测序数据的形式提供,使用时应围绕转录组学分析的一般流程组织工作,包括数据获取、表达定量或表达矩阵整理、样本分组与比较分析等。由于数据集包含 18 例 ACP 样本、3 例胎儿垂体与 3 例无功能垂体腺瘤,分析设计上可将 ACP 与后两类样本分别或合并进行对照比较。关于数据的具体下载地址、文件格式、访问方式、是否需注册或申请权限,以及是否附带预处理流程与代码,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的样本规模为 18 例 ACP 样本、3 例胎儿垂体、3 例无功能垂体腺瘤,其中胎儿垂体与无功能垂体腺瘤的例数较少,在涉及这两类样本的比较分析中需注意样本量的影响。关于数据质量评估指标、测序深度、数据完整性、批次效应、样本纳入排除标准以及数据可能存在的技术偏倚,源站未提供。使用时应结合具体分析目的谨慎解读结果。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、原始文献、数据许可协议与使用条款,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-5267

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNA sequencing of 18 human ACP samples, 3 foetal pituitaries, 3 non functioning pituitary adenomas

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案