GSE239695 颅咽管瘤DNA甲基化数据集
ACP DNA甲基化芯片数据
基本信息
资源简介
GSE239695 颅咽管瘤DNA甲基化数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Tumor DNA methylation profiling of patients with Adamantinomatous craniopharyngioma (ACP)》。源站首次发布：Jul 31 202。
【数据内容】
源站原始描述：Abnormal DNA methylation plays a role in tumor progression and is becoming recognized as a prognostic marker in various types of cancers. In this study, we aimed to investigate the association between DNA methylation and clinicopathological features, prognosis, and outcomes in patients with Adamantinomatous craniopharyngioma (ACPs). To achieve this, we analyzed the global methylation profile of 35 tumors using the Illumina Infinium HumanMethylation850 BeadChip
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Methylation profiling by genome tiling array、GPL23976、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239695
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 02 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239695
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含35例 adamantinomatous craniopharyngioma 肿瘤样本的DNA甲基化芯片数据，用于预后、临床病理特征和表观遗传分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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