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创建/更新时间

2026-10-09

资源简介

ENA数据集MUG样本

ena-DATASET-MUG-04-05-2020-16:06:55:508-581 - samples 是一个面向结直肠癌分子特征研究的肿瘤基因组学数据集，收录于 omicsdi.org，在本站归类于肿瘤 / 结肠癌方向，主题标签为 Genomics。该数据集围绕结直肠癌患者血浆 DNA 的基因突变分析展开，采用 AVENIO ctDNA Targeted Kit 进行检测，覆盖 ALK、APC、BRAF、BRCA1、BRCA2、DPYD、EGFR、ERBB2、KIT、KRAS、MET、NRAS、PDGFRA、RET、ROS1、TP53、UGT1A1 共 17 个基因。整体而言，它为结直肠癌相关基因突变谱研究、ctDNA 检测方法评估以及肿瘤分子特征分析提供了可用的样本层面数据资源，适合关注液体活检与结直肠癌精准医学方向的研究者参考使用。

【数据集背景】

结直肠癌是全球范围内常见的恶性肿瘤之一，其发生发展涉及多个基因的突变累积。随着液体活检技术的发展，基于血浆游离 DNA（ctDNA）的检测逐渐成为解析肿瘤分子特征的重要手段。该数据集正是在这一背景下产生，聚焦于结直肠癌患者血浆 DNA 中的基因突变分析，主题标签为 Genomics，本站分类为肿瘤 / 结肠癌，来源站为 omicsdi.org。它面向的是结直肠癌分子机制与临床转化研究中对突变谱数据的需求。

【数据内容】

该数据集的核心内容是对结直肠癌患者血浆 DNA 进行突变分析，检测范围涵盖 17 个基因：ALK、APC、BRAF、BRCA1、BRCA2、DPYD、EGFR、ERBB2、KIT、KRAS、MET、NRAS、PDGFRA、RET、ROS1、TP53、UGT1A1。检测所使用的工具为 AVENIO ctDNA Targeted Kit。数据集名称中包含“samples”字样，表明其以样本为组织单位。除上述基因列表与检测工具外，源站未提供关于样本数量、突变位点、变异频率、临床信息等更细粒度的内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org，本站将其归入肿瘤 / 结肠癌分类，主题标签为 Genomics。其检测对象为结直肠癌患者的血浆 DNA，检测手段为 AVENIO ctDNA Targeted Kit 靶向测序方案。关于样本采集时间、采集地点、队列构成、伦理审批等具体采集信息，源站未提供。

【适用场景】

依据其主题与检测内容，该数据集可用于结直肠癌相关基因突变谱研究，帮助研究者了解上述 17 个基因在结直肠癌血浆 DNA 中的突变情况；也可用于 ctDNA 检测方法评估，尤其是针对 AVENIO ctDNA Targeted Kit 这一靶向检测方案的应用评价；此外，还可服务于肿瘤分子特征分析等场景。这些适用方向与来源 omicsdi.org 的描述一致。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、文件格式、分析流程、配套工具或代码等均未说明。使用者如需使用，应参考来源站 omicsdi.org 上的原始条目获取进一步指引。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、覆盖深度、重复性验证等方面的信息。其检测范围明确限定为 17 个基因，属于靶向 panel 设计，因此不覆盖全基因组或全外显子层面的变异信息。此外，数据集名称中包含“samples”，提示其可能为样本层级数据，但具体样本规模与代表性未知。以上限制均基于现有信息，源站未提供更详细的质量说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在使用前应查阅 omicsdi.org 上该数据集的原始页面，以获取准确的引用规范与授权条款。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006103

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006103

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Mutation analysis of 17 genes (ALK, APC, BRAF, BRCA1, BRCA2, DPYD, EGFR, ERBB2, KIT, KRAS, MET, NRAS, PDGFRA, RET, ROS1, TP53, UGT1A1) in plasma DNA of CRC patients using the AVENIO ctDNA Targeted Kit.

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别