膜相关Rap1复合物中Raf亚型特异性的构象动力学与RBD-CRD耦合
Rap1-B-Raf RBD-CRD复合物采样膜远端(占比较多)与膜近端(占比较少)构象。相比之下,Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物主要采样膜远端构象

基本信息
资源简介
膜相关Rap1复合物中Raf亚型特异性的构象动力学与RBD-CRD耦合
该数据集聚焦于膜相关Rap1复合物中Raf亚型特异性的构象动力学基础,收录了膜结合状态下Rap1-B-Raf RBD-CRD与Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物的代表性构象。源站描述表明,Rap1-B-Raf RBD-CRD复合物可采样膜远端(占比较多)与膜近端(占比较少)两类构象;相比之下,Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物主要采样膜远端构象;膜结合的游离Rap1同样以膜远端构象集合为主。该数据集从构象分布差异的角度,为理解Raf亚型在膜相关Rap1复合物中的特异性提供了结构层面的观察素材,本站将其归入肿瘤/结肠癌分类,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可发布。
【数据集背景】
Rap1与Raf家族激酶在膜环境中的相互作用是理解Raf亚型功能差异的重要环节。Raf各亚型在结构组成上具有相似性,但在膜相关复合物中的行为可能不同。该数据集围绕膜相关Rap1-B-Raf RBD-CRD与Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物展开,关注RBD-CRD片段在膜表面的构象采样特征,并同时纳入膜结合的游离Rap1作为参照。其核心观察在于不同Raf亚型与Rap1形成复合物后,在膜远端与膜近端构象之间的分布存在明显差异,这一差异构成了理解Raf亚型特异性的结构动力学线索。本站将其归入肿瘤/结肠癌分类,提示该主题在肿瘤相关信号研究中的潜在关联。
【数据内容】
数据集收录的对象为膜相关Rap1-B-Raf RBD-CRD复合物、Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物以及膜结合的游离Rap1的代表性构象。就构象分布而言,Rap1-B-Raf RBD-CRD复合物同时采样膜远端与膜近端构象,其中膜远端构象占比较多、膜近端构象占比较少;Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物则主要采样膜远端构象;膜结合的游离Rap1也以膜远端构象集合为主。上述内容以代表性构象的形式呈现,用于刻画不同复合物在膜表面附近构象采样的偏好性。除这些构象描述外,源站未提供其他具体数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于doi.org,作者为Xu, Liang,机构为Zenodo,发布时间为2026年。源站描述给出了各复合物代表性构象及其膜远端/膜近端构象采样倾向的说明。关于具体的采集方法、模拟或实验手段、样本处理流程等技术细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于关注Rap1与Raf亚型相互作用的研究场景,例如比较B-Raf与Raf-1在膜相关Rap1复合物中的构象采样差异、讨论RBD-CRD片段在膜远端与膜近端构象之间的分布对亚型特异性的意义,以及将膜结合游离Rap1的构象偏好作为参照进行分析。结合本站肿瘤/结肠癌分类,该数据也可作为肿瘤相关信号通路结构机制讨论的辅助材料。关于具体应用案例或验证结果,源站未提供。
【使用方法】
使用者可依据源站描述,将Rap1-B-Raf RBD-CRD复合物的膜远端与膜近端构象采样差异,与Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物主要采样膜远端构象的特征进行对照,并以膜结合游离Rap1的膜远端构象偏好作为背景参照。由于源站未提供文件组织、格式规范或操作步骤等说明,具体使用方式需参照源站发布内容,源站未提供进一步的使用方法细节。
【质量与限制】
该数据集以代表性构象描述为核心,构象占比仅以“较多/较少”“主要”等相对表述呈现,源站未提供定量指标、统计方法或误差评估信息。数据仅涉及RBD-CRD片段与膜结合Rap1的相关复合物,源站未提供其他复合物或完整蛋白层面的信息。关于数据质量评估、验证实验或局限性说明,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集作者为Xu, Liang,机构为Zenodo,发布时间为2026年,来源站为doi.org。许可为Creative Commons Attribution 4.0 International,使用时应遵循该许可的署名要求。具体的引用格式与致谢方式,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22013882
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 14.59 GB。
数据说明
膜结合的Rap1-B-Raf RBD-CRD和Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物的代表性构象。Rap1-B-Raf RBD-CRD复合物采样了膜远侧(分布更多)和膜近侧(分布较少)构象。相比之下,Rap1-Raf-1 RBD-CRD复合物主要采样膜远侧构象。膜结合的游离Rap1也主要采样膜远侧构象集合。
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