结肠炎相关结肠癌的空间分辨转录组与细胞图谱
该数据集提供了结肠炎相关结肠癌患者样本的空间转录组数据，包含Xenium平台生成的高分辨率基因表达与细胞定位信息，数据模态为空间转录组学与单细胞注释。它整合了患者分组、疾病状态及多层次细胞类型（如上皮、免疫、基质细胞），并包含计算的空间邻域特征，主要用于研究结肠癌的肿瘤微环境空间结构、细胞异质性、炎症与癌症的相互作用，为癌症机制探索和生物标志物发现提供关键数据支持。
基本信息
资源简介
结肠炎相关结肠癌的空间分辨转录组与细胞图谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《A spatially resolved transcriptomic and cellular landscape of colitis-associated colon cancer》。源站首次发布：2025-12-10。
【数据内容】
源站原始描述：Spatial transcriptomics datasets (Xenium Prime and Xenium v1) generated from colitis-associated colon cancer patient samples. Processed data are provided as .h5ad files. CAC_XeniumPrime_integrated.h5ad - Xenium Prime 5K data (default segmentation) with Novae computed niches and Novae spatial niches UMAP CAC_XeniumPrime_integrated_HarmonyUMAP.h5ad - Xenium Prime 5K data (default segmentation) with Novae computed niches with Harmony UMAP CAC_Xenium477_Harmony.h5ad - Xenium v1 dataset with default…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.5281/zenodo.17886669。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/17886669
使用许可：cc-by-4.0。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-12-15，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17886669
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数据说明
该数据集是一个空间转录组学数据集，来源于结肠炎相关结肠癌（CAC）患者样本，使用Xenium Prime和Xenium v1平台生成。数据以.h5ad文件格式提供，包含经过整合与处理的空间转录组数据，涵盖不同患者分组、疾病类型（CAC、UC、HC）以及多层次的细胞类型注释（如上皮细胞、淋巴样细胞、髓样细胞、基质细胞等细分子类）。数据集还计算了Novae细胞邻域等空间特征，可用于研究结肠癌的肿瘤微环境、细胞异质性、空间组织结构及其与炎症性肠病的关联，为癌症生物学、免疫学和空间组学研究提供重要资源。
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