GSE2535 CML伊马替尼应答预测表达谱数据集

包含CML患者对伊马替尼治疗应答与非应答的血液或骨髓表达谱数据,可用于药物反应分类。由Oregon Health & Science University提供,来自Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含28条数据记录,专注于肿瘤领域的慢性髓系白血病研究。

Oregon Health & Science UniversityOregon Health & Science University
Gene Expression Omnibus
2018-12-13 更新
浏览 14
表格分类Expression profiling by arrayGPL83009606
GSE2535

基本信息

模态
表格
大小
0.079693312 GB
数据量
28
任务类型
分类
创建/更新时间
2018-12-13

资源简介

GSE2535 CML伊马替尼应答预测表达谱数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Expression data in patients with chronic myelogenous leukemia for response to imatinib》。源站首次发布:Apr 18 200。

【数据内容】

源站原始描述:This is a class prediction experiment, where the class is the response status to imatinib (also called Gleevec), a drug used to treat patients with chronic myelogenous leukemia (CML). There are two data sets, a training set (from Leipzig, 8 Responders and 5 Non-Responders) and a validation set (from Mannheim, 8 Responders and 7 Non-Responders). The objective is to identify differentially regulated genes between CML patients who respond and those who do not respond to imatinib and confirm the res…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL8300、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2535

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 13 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含CML患者对伊马替尼治疗应答与非应答的血液或骨髓表达谱数据,可用于药物反应分类。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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