家族性慢性淋巴细胞白血病的全基因组测序数据
该数据集包含来自三个家族性慢性淋巴细胞白血病（CLL）病例的全基因组测序（WGS）数据，涵盖9名个体的肿瘤和正常组织样本，数据模态为基因组序列文件（BAM格式）以及免疫球蛋白重排的Sanger测序结果，主要用于研究CLL的遗传易感性和家族性发病机制，为探索白血病遗传因素提供关键分子数据。
基本信息
资源简介
家族性慢性淋巴细胞白血病的全基因组测序数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《WGS in familial chronic lymphocytic leukemia》。配套论文《Consistent B Cell Receptor Immunoglobulin Features Between Siblings in Familial Chronic Lymphocytic Leukemia》发表于 Frontiers in Oncology（2021），DOI：10.3389/fonc.2021.740083。源站首次发布：2021-07-12。
【数据内容】
源站原始描述：Data Set Description This repository contains data from a study of three families in which two or more siblings developed chronic lymphocytic leukemia (CLL). Informed consent was provided in accordance with the declaration of Helsinki and the study was approved by the hospital medical ethics committee (METC2015-741). The data consists of BAM-files from whole-genome sequencing (WGS) of nine individuals with data from tumor and matched normal tissue. WGS libraries where prepared using the TruSeq N…
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.17044/scilifelab.14932062.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer genetics、Haematology。主题标签：WGS、CLL、familial、Cancer Genetics、Hematology。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cancer genetics、Haematology。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/WGS_in_familial_chronic_lymphocytic_leukemia/14932062
使用许可：Restricted Access（https://www.scilifelab.se/data/restricted-access/）。
规范引用：Ljungström, Viktor; Rosenquist Brandell, Richard (2021). WGS in familial chronic lymphocytic leukemia. Karolinska Institutet. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-01-15，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/WGS_in_familial_chronic_lymphocytic_leukemia/14932062
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集包含一项针对三个家族的研究数据，这些家族中有两个或更多兄弟姐妹患有慢性淋巴细胞白血病（CLL）。数据包括来自9名个体的全基因组测序（WGS）BAM文件，涵盖肿瘤组织和匹配的正常组织样本。测序使用Illumina HiSeqX Ten系统进行，目标覆盖度为30倍，并经过BWA、Picard、GATK和SAMtools等标准生物信息学流程处理。此外，数据集还提供了肿瘤样本免疫球蛋白重排的Sanger测序结果。数据访问受限制，仅可用于研究家族性CLL遗传因素的相关科研项目。
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