ICGC CLL 450k DNA 甲基化数据集
该数据集来自 omicsdi.org,收录 ICGC CLL 患者的 DNA 甲基化数据,采用 Illumina 450k 芯片进行测量

基本信息
资源简介
ICGC CLL 450k DNA 甲基化数据集
ICGC CLL 450k DNA methylation 是一个聚焦于慢性淋巴细胞白血病(CLL)的 DNA 甲基化数据集,归属于肿瘤研究领域。该数据集来源于 omicsdi.org,收录了 ICGC CLL 患者的 DNA 甲基化数据,测量平台为 Illumina 450k 芯片。从主题标签来看,其核心方向为基因组学。整体而言,该数据集围绕 CLL 这一特定血液系统恶性肿瘤,提供了基于芯片技术获取的甲基化层面信息,可用于探索该疾病在表观遗传层面的特征。以下将从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
慢性淋巴细胞白血病是一种常见的血液系统恶性肿瘤,其发生发展涉及遗传与表观遗传等多层面改变。DNA 甲基化作为重要的表观遗传修饰,在基因表达调控、基因组稳定性维持等方面发挥关键作用。该数据集以 ICGC CLL 患者为对象,旨在通过 Illumina 450k 芯片获取甲基化数据,为相关研究提供表观遗传层面的数据支撑。其主题标签为 Genomics,表明该数据集主要服务于基因组学及表观基因组学方向的研究需求。
【数据内容】
该数据集收录的是 ICGC CLL 患者的 DNA 甲基化数据,测量手段为 Illumina 450k 芯片。源站描述为“DNA methylation of ICGC CLL patients measured by Illumina 450k array”。数据集英文名称为 ICGC CLL 450k DNA methylation,本站分类为肿瘤 / 慢性淋巴细胞白血病。除上述信息外,关于样本数量、甲基化位点数量、具体临床信息、数据文件格式等,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 omicsdi.org,源站描述指出其测量对象为 ICGC CLL 患者,测量平台为 Illumina 450k 芯片。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、患者纳入与排除标准、采集时间与地点等,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签 Genomics 以及肿瘤 / 慢性淋巴细胞白血病的分类,该数据集可应用于慢性淋巴细胞白血病相关的表观遗传研究,例如探索 DNA 甲基化模式与疾病特征之间的关联。由于采用 Illumina 450k 芯片测量,其数据可用于甲基化层面的分析。关于具体的适用研究设计、分析目标或验证场景,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 omicsdi.org,可通过该来源获取。关于数据下载方式、预处理步骤、归一化方法、分析工具或流程等,源站未提供。
【质量与限制】
关于该数据集的数据质量评估、缺失值情况、批次效应、样本代表性等,源站未提供。其测量平台为 Illumina 450k 芯片,相关技术局限可参考该平台的通用特性,但该数据集自身的具体质量指标与限制,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001975
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DNA methylation of ICGC CLL patients measured by Illumina 450k array
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