ULB数据集样本
该数据集来自慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的外周血单个核细胞(PBMC),经密度梯度离心分离后,使用CD19+磁珠系统纯化B细胞,平均B细胞纯度>99%,纯化后CD5+/CD19+细胞平均比例>98%

基本信息
资源简介
ULB数据集样本
该数据集来自慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的外周血单个核细胞(PBMC),经密度梯度离心分离后,使用CD19+磁珠系统纯化B细胞,平均B细胞纯度>99%,纯化后CD5+/CD19+细胞平均比例>98%。提取总RNA后,采用TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kit构建全转录组测序文库,在HiSeq 2500平台上进行2×76 bp双端测序,双端读段中位数为6050万(范围4970万-7970万)。数据可用于CLL相关转录组分析、基因表达研究及B细胞分子特征探索(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的外周血单个核细胞(PBMC)通过Linfosep(Biomedics,马德里,西班牙)密度梯度离心分离。B细胞按照制造商说明使用CD19+磁珠系统(MidiMACS,Miltenyi Biotec,Bergish Gladbash,德国)纯化。经流式细胞术检测,平均B细胞纯度>99%,纯化后CD5+/CD19+细胞的平均百分比>98%。使用TriPure Isolation Reagent(Roche Applied Science,Vilvoorde,比利时)一步法从纯化细胞中提取总RNA。使用TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kit(Illumina)制备全转录组测序文库。文库在HiSeq 2500仪器(Illumina)上进行2 × 76 bp双端测序。双端读段的中位数为6050万(范围,4970万-7970万)。
【主题与分类】
主题标签:Genomics。本站分类:肿瘤/慢性淋巴细胞白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004047
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004047
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用密度梯度离心法,在Linfosep(西班牙马德里Biomedics公司)上分离出CLL患者的外周血单核细胞(PBMC)。依据制造商说明,使用CD19+磁珠系统(德国Bergish Gladbash的Miltenyi Biotec公司MidiMACS)纯化B细胞。经流式细胞术检测,纯化后B细胞平均纯度>99%,CD5+/CD19+细胞平均百分比>98%。使用TriPure Isolation Reagent(比利时Vilvoorde的Roche Applied Science公司)一步法从纯化细胞中提取总RNA。采用TruSeq Stranded Total RNA Sample Preparation Kit(Illumina公司)构建全转录组测序文库。文库在HiSeq 2500仪器(Illumina公司)上进行2×76 bp双端测序。双端读取的中位数为6050万条(范围,4970万至7970万条)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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