CLL分子图谱

整合CLL患者基因组、转录组和表观组数据,用于驱动基因发现、分型和预后分析。由Broad Institute / ICGC-CLL Consortium提供,来自CLL-map Portal,包含多种数据模态,包含1148条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的慢性淋巴细胞白血病研究。

Broad Institute / ICGC-CLL ConsortiumBroad Institute / ICGC-CLL Consortium
CLL-map Portal
浏览 15
多模态分类chronic lymphocytic leukemiaCLLmolecular mapgenomicsoutcome
CLL-map

基本信息

模态
多模态
数据量
1148
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-28

资源简介

CLL分子图谱

【一句话概览】

CLL-map 项目数据门户上线,相关成果为《慢性淋巴细胞白血病分子图谱及其对结局的影响》,发表于 Nature Genetics(在线,PubMed)。该研究由 Binyamin A. Knisbacher、Ziao Lin、Cynthia K. Hahn、Ferran Nadeu、Martí Duran-Ferrer 等共同第一作者完成,Elías Campo、Gad Getz 等共同指导,聚焦慢性淋巴细胞白血病(CLL)的分子图谱、基因组学与结局。问题与反馈可发送至 admin@cllmap.org(来源 cllmap.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《CLL-map》。

【数据内容】

源站原始描述:Welcome to the CLL-map project data portal Citation: Molecular map of chronic lymphocytic leukemia and its impact on outcome Nature Genetics , in press ( online , PubMed ) Binyamin A. Knisbacher*, Ziao Lin*, Cynthia K. Hahn*, Ferran Nadeu*, Martí Duran-Ferrer*, Kristen E. Stevenson, Eugen Tausch, Julio Delgado, Alex Barbera-Mourelle, Amaro Taylor-Weiner, Pablo Bousquets-Muñoz, Ander Diaz-Navarro, Andrew Dunford, Shankara Anand, Helene Kretzmer, Jesus Gutierrez-Abril, Sara López-Tamargo, Stacey M…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):欢迎访问CLL-map项目数据门户 引用:慢性淋巴细胞白血病的分子图谱及其对预后的影响《自然遗传学》,出版中(在线,PubMed)Binyamin A. Knisbacher*,Ziao Lin*,Cynthia K. Hahn*,Ferran Nadeu*,Martí Duran-Ferrer*,Kristen E. Stevenson,Eugen Tausch,Julio Delgado,Alex Barbera-Mourelle,Amaro Taylor-Weiner,Pablo Bousquets-Muñoz,Ander Diaz-Navarro,Andrew Dunford,Shankara Anand,Helene Kretzmer,Jesus Gutierrez-Abril,Sara López-Tamargo,Stacey M. Fernandes,Clare Sun,Mariela Sivina,Laura Z. Rassenti,Christof Schneider,Shuqiang Li,Laxmi Parida,Alexander Meissner,François Aguet,Jan A. Burger,Adrian Wiestner,Thomas J. Kipps,Jennifer R. Brown,Michael Hallek,Chip Stewart,Donna S. Neuberg,José I. Martín-Subero**,Xose S. Puente**,Stephan Stilgenbauer**,Catherine J. Wu**,Elías Campo**,以及Gad Getz** * 同等贡献 ** 共同指导 问题与反馈可发送至admin@cllmap.org

【主题与分类】

主题标签:chronic lymphocytic leukemia、CLL、molecular map、genomics、outcome。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://cllmap.org/

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使用方式

数据集获取

源站:https://cllmap.org/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

整合CLL患者基因组、转录组和表观组数据,用于驱动基因发现、分型和预后分析。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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