模式化慢性淋巴细胞白血病的染色质激活谱

该数据集包含来自慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者和正常B细胞的染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)与RNA-seq数据,以计数矩阵形式提供H3K27ac组蛋白标记和基因表达信息,数据模态涉及表观基因组和转录组,主要用于研究CLL的染色质激活模式、表观遗传调控机制以及疾病亚型分析,为白血病生物标志物发现和精准医疗提供支持。

CNAG-CRGCNAG-CRG
Zenodo
2022-11-24 更新
浏览 9
分类
CHROMATIN ACTIVATION PROFILING OF STEREOTYPED CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIAS

基本信息

大小
0.05 GB
任务类型
分类
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2022-11-24

资源简介

模式化慢性淋巴细胞白血病的染色质激活谱

【数据集背景】

本数据集源站标题为《CHROMATIN ACTIVATION PROFILING OF STEREOTYPED CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIAS》。源站首次发布:2022-07-21。

【数据内容】

源站原始描述:We used chromatin-immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-Seq) with an antibody for the H3K27ac (a bona fide histone mark for regulatory element activation) in sorted CLL cells from 46 CLL, including 21 cases from stereotyped subsets #1, #2, #4, and #8, and 15 normal B cell subpopulations. To understand their functional impact, we integrated our data with 16 RNA-seq data. Files description: - H3K27ac_freq2_FDR_consensus_2022.txt count matrix from H3K27ac signals - H3K27ac_FDR_consensus_…

主表 signature_RESAMPLING_ss8VSucll_2022.txt 含 67 列、样本前 1186 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 51.38 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.7353716。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/7353716

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2022-11-24,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/record/7353716

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数据说明

该数据集是一个用于研究模式化慢性淋巴细胞白血病(CLL)染色质激活状态的生物信息学数据集。它包含通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)技术获得的H3K27ac组蛋白标记数据,以及整合的RNA-seq数据,覆盖了46例CLL患者(包括21例来自#1、#2、#4和#8模式化亚群)和15个正常B细胞亚群的样本。数据以计数矩阵形式提供,包括原始H3K27ac信号矩阵、批次效应校正后的H3K27ac矩阵和RNA-seq矩阵。该数据集旨在分析CLL中调控元件的激活模式,探索染色质修饰与基因表达的关系,主要应用于白血病表观遗传学、疾病亚型分型和生物标志物发现等研究方向。

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