圣犹大儿童癌症基因组计划
圣犹大儿童癌症基因组计划收录儿童肿瘤的肿瘤-正常配对基因组、外显子组和RNA测序数据，可用于罕见儿童脑肿瘤研究。由St. Jude Children’s Research Hospital提供，来自Childhood Cancer Data Initiative Data Catalog，数据格式为表格，包含1610条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的脉络丛癌研究。
基本信息
资源简介
圣犹大儿童癌症基因组计划
【一句话概览】
2010年，圣裘德儿童研究医院与华盛顿大学医学院启动一项6500万美元、为期三年的儿童癌症基因组计划，旨在描绘儿童癌症的基因组图谱，包括一些最不被了解、最具挑战性的癌症。项目目标是对600名儿童癌症患者的完整正常与癌症基因组进行测序，最终完成约800名患者的完整及正常基因组测序，并对另外1200名患者进行全外显子组和全转录组测序，涵盖20多种癌症（来源 datacatalog.ccdi.cancer.gov）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Pediatric Cancer Genome Project》。
【数据内容】
源站原始描述：In 2010, St. Jude Children''s Research Hospital and Washington University School of Medicine launched a $65 million, three-year project to define the genomic landscape of pediatric cancer, including some of the least understood and most challenging cancers. The project goal was to sequence the complete normal and cancer genomes of 600 pediatric cancer patients. The St. Jude-Washington University Pediatric Cancer Genome Project became an ambitious effort to discover the origins of pediatric cancer…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：2010年，圣裘德儿童研究医院与华盛顿大学医学院共同启动了一个耗资6500万美元、为期三年的项目，旨在描绘儿童癌症的基因组图谱，其中包括一些最不为人所知且最具挑战性的癌症。该项目目标是对600名儿童癌症患者的完整正常基因组和癌症基因组进行测序。圣裘德-华盛顿大学儿童癌症基因组项目成为了一项雄心勃勃的努力，旨在发现儿童癌症的起源并寻求新的治疗方法。该项目最终对约800名儿童癌症患者的完整及正常基因组进行了测序，并额外对1200名患者进行了全外显子组和全转录组测序，涵盖了20多种不同的癌症。
【主题与分类】
主题标签：Pediatric Cancer、Genomics、Whole Genome Sequencing、Whole Exome Sequencing、RNA Sequencing、St. Jude Cloud。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://datacatalog.ccdi.cancer.gov/dataset/St.%20Jude%20Cloud-PCGP
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://datacatalog.ccdi.cancer.gov/dataset/St.%20Jude%20Cloud-PCGP
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
圣犹大儿童癌症基因组计划收录儿童肿瘤的肿瘤-正常配对基因组、外显子组和RNA测序数据，可用于罕见儿童脑肿瘤研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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