MUG-Chor1与UM-Chor1细胞系的CRISPR-Cas9筛选数据集
该数据集包含脊索瘤细胞系MUG-Chor1和UM-Chor1的基因组规模CRISPR-Cas9筛选读段计数数据,每个细胞系提供三个生物学重复,数据模态为基因筛选的计数数据,主要用于脊索瘤的基因功能研究、疾病机制探索及潜在治疗靶点识别。

基本信息
资源简介
MUG-Chor1与UM-Chor1细胞系的CRISPR-Cas9筛选数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《CRISPR-Cas9 screening data for MUG-Chor1 and UM-Chor1 cell lines》。源站首次发布:2019-01-21。
【数据内容】
源站原始描述:Read-count data for genome-scale CRISPR-Cas9 screens performed in MUG-Chor1 and UM-Chor1 chordoma cell lines. Data for three biological replicates per cell line are provided. Each file corresponds to a sequencing technical replicate for the three biological samples. The reference pDNA batch for these screens is batch 2. Read counts for batch 2 pDNA can be found in the raw_readcounts file in avana_public_18Q4 at
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个,合计 19.49 MB。MUG-Chor1 and UM-Chor1 read counts_replicate 3.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,4.87 MB。MUG-Chor1 and UM-Chor1 read counts_replicate 4.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,4.87 MB。MUG-Chor1 and UM-Chor1 read counts_replicate 1.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,4.87 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.7302515.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。主题标签:CRISPR-Cas9 screens、Cancer。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Oncology and carcinogenesis not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/CRISPR-Cas9_screening_data_for_MUG-Chor1_and_UM-Chor1_cell_lines/7302515
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Sharifnia, Tanaz (2019). CRISPR-Cas9 screening data for MUG-Chor1 and UM-Chor1 cell lines. figshare. Dataset
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是脊索瘤(Chordoma)细胞系MUG-Chor1和UM-Chor1的基因组规模CRISPR-Cas9筛选数据,包含每个细胞系三个生物学重复的读段计数数据。每个文件对应三个生物样本的测序技术重复。数据来源为公开的CRISPR筛选实验,参考pDNA批次为批次2,其读段计数可在avana_public_18Q4的原始读段计数文件中找到。该数据集主要用于脊索瘤的基因功能研究、疾病机制探索及潜在治疗靶点筛选。
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