脊索瘤女性56岁组织图像及基因组转录组数据

数据包含一名56岁女性脊索瘤患者的组织图像及基因组和转录组序列信息,本站分类为肿瘤/脊索瘤。可用于脊索瘤的分子特征研究、个性化肿瘤基因组学分析及相关图像与组学联合探索(来源 EGA)

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基因组None
Chondroid chordoma - Female, 56 - Tissue image [6270730022337071]

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

脊索瘤女性56岁组织图像及基因组转录组数据

该数据集英文名为“Chondroid chordoma - Female, 56 - Tissue image [6270730022337071]”,源站标题为“Genome and transcriptome sequence data from a chordoma patient”,本站分类为肿瘤/脊索瘤,来源站为 ega-archive.org。数据包含一名56岁女性脊索瘤患者的组织图像及基因组和转录组序列信息,可用于脊索瘤的分子特征研究、个性化肿瘤基因组学分析及相关图像与组学联合探索。源站描述指出,这些基因组和转录组序列数据来自一名脊索瘤患者,是作为BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究的一部分产生的。整体来看,该数据集围绕单一脊索瘤病例,将组织图像与基因组、转录组序列信息汇集在一起,为在肿瘤/脊索瘤分类下开展分子层面与图像层面的联合研究提供了数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于ega-archive.org,源站标题为“Genome and transcriptome sequence data from a chordoma patient”。其产生背景与BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究相关,源站描述明确说明这些基因组和转录组序列数据是作为该研究的一部分生成的。数据集在本站被归类为肿瘤/脊索瘤,英文名称中标注了“Chondroid chordoma - Female, 56 - Tissue image”,表明该数据对应一名56岁女性软骨样脊索瘤患者的组织图像,并同时涉及该患者的基因组与转录组序列信息。关于该研究更具体的立项背景、研究目的与组织方式,源站未提供。

【数据内容】

数据内容包括一名56岁女性脊索瘤患者的组织图像,以及该患者的基因组和转录组序列信息。英文名称中的“Tissue image”及方括号内的标识指向组织图像数据;源站标题与描述则表明数据主体为基因组和转录组序列数据。本站分类为肿瘤/脊索瘤,主题标签为None。除上述内容外,数据的具体文件构成、图像数量、序列数据规模、测序平台、样本类型细分等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为ega-archive.org。源站描述说明,这些基因组和转录组序列数据来自一名脊索瘤患者,并作为BC Cancer Agency的Personalized OncoGenomics(POG)研究的一部分生成。数据集英文名称标注患者为女性、56岁,并包含组织图像。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、数据提交机构与提交时间等,源站未提供。

【适用场景】

根据数据内容与分类,该数据集可用于脊索瘤的分子特征研究、个性化肿瘤基因组学分析,以及相关图像与组学联合探索。由于数据同时包含组织图像和基因组、转录组序列信息,适合在肿瘤/脊索瘤方向开展图像信息与分子信息相结合的探索性分析。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、访问权限申请流程、文件格式说明、分析流程建议等。使用者需依据来源站ega-archive.org的相关规定获取和使用数据。

【质量与限制】

该数据集对应单一患者病例,英文名称标注为56岁女性软骨样脊索瘤,并包含组织图像及基因组和转录组序列信息。关于数据质量评估指标、数据完整性、覆盖度、测序深度、图像分辨率等具体质量信息,源站未提供。由于数据仅涉及一名患者,其在群体层面的代表性存在固有局限;除此一般性认识外,关于该数据集的具体限制,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。使用该数据集时,应遵循来源站ega-archive.org的相关要求;具体的引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001003040

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Genome and transcriptome sequence data from a chordoma patient [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001003040

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