人类胆管癌的分子分类
人类胆管癌的分子分类数据集，包含基因表达等数据，用于研究胆管癌的分子亚型。
基本信息
资源简介
人类胆管癌的分子分类
【一句话概览】
本数据集是 BioStudies 公开的组学数据集，主题涵盖 transcription profiling by array、Homo sapiens，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Molecular classification of human cholangiocarcinoma》。
【数据内容】
源站原始描述：Transcriptomic profiling Background Cholangiocarcinoma accounts for 5-10% of primary hepatic cancers. The etiology is unclear and patients are often diagnosed without risk factors. Resection is the only curative treatment although patients frequently remain undiagnosed until advanced stage of disease. Methods To construct molecular classification of cholangiocarcinoma, we profiled the transcriptomes of 104 freshly-frozen tumors and 59 matched non-cancerous livers obtained from Australia, Europe…
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-26566
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ebi.ac.uk/biostudies/ArrayExpress/studies/E-GEOD-26566
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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