肝内胆管癌中可干预的FGFR2-PPHLN1融合和ARAF突变的大规模并行测序
肝内胆管癌患者配对样本的RNA-seq和全外显子测序数据，用于发现FGFR2-PPHLN1融合和ARAF突变。
基本信息
资源简介
肝内胆管癌中可干预的FGFR2-PPHLN1融合和ARAF突变的大规模并行测序
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 GPL16791、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Massive parallel sequencing uncovers actionable FGFR2-PPHLN1 fusion and ARAF mutations in intrahepatic cholangiocarcinoma》。源站首次发布：Nov 18 201。
【数据内容】
源站原始描述：Intrahepatic cholangiocarcinoma (iCCA) is a fatal bile duct cancer with dismal prognosis and limited therapeutic options. By performing RNA- and exome sequencing analyses we have discovered a novel fusion event, FGFR2-PPHLN1 (16%), and damaging mutations in the ARAF oncogene (11%)
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：肝内胆管癌（iCCA）是一种致命的胆管癌，预后极差，治疗选择有限。通过进行RNA和外显子组测序分析，我们发现了一种新的融合事件FGFR2-PPHLN1（16%），以及ARAF癌基因中的有害突变（11%）。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：GPL16791、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE63420
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE63420
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- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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