墨西哥和波多黎各HIV感染者宫颈与肛门高级别鳞状上皮内病变筛查算法研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05074264

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：艾滋病相关肛门癌、艾滋病相关宫颈癌、高度肛门上皮内瘤变、高度宫颈上皮内瘤变、HIV感染。主要目标：I. 评估结合即时检验（POC）HPV筛查与几种分诊替代方案的最有效算法：细胞学、E6和/或E7癌蛋白检测及S5甲基化，以改进当前在墨西哥和波多黎各的HIV感染男性和女性中检测肛门生殖器HPV相关癌症和癌前病变的筛查方案。探索性目标：I. 评估基于宫颈手机图像的人工智能算法在墨西哥和波多黎各HIV感染女性中检测宫颈癌和癌前病变的敏感性、特异性以及阴性和阳性预测值。II. 评估参与者采集的宫颈阴道样本与临床医生采集的宫颈样本之间的HPV一致性/符合度。概述：患者根据入组时的解剖结构接受标准医疗程序。

第一组（HIV感染女性（WLWH））：患者接受宫颈图像采集、3份宫颈拭子和3份肛门拭子采集，用于在90分钟内实时检测高危（hr）HPV。宫颈拭子hrHPV检测阳性的患者接受阴道镜检查和可见病变活检。宫颈拭子hrHPV检测阴性的患者可接受阴道镜检查。肛门拭子hrHPV检测阳性的患者在1个月内的后续就诊中接受高分辨率肛门镜检查。肛门拭子hrHPV检测阴性的患者可接受高分辨率肛门镜检查和可见病变活检，肛门细胞学检查为低度鳞状上皮内病变（LSIL）或更严重病变的患者在1个月内接受高分辨率肛门镜检查和活检。患者可能在第二次就诊时获得诊断和治疗。诊断为HSIL的患者可接受标准治疗（SOC）或在研究开放入组时参加其他研究。第二组（HIV感染男性（MLWH））：患者接受3份肛门拭子采集，用于实时检

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。