复现数据：3型HPV mRNA检测用于宫颈细胞学质控提高挪威年轻女性宫颈上皮内瘤变2级及以上筛查项目敏感性的队列研究

数据集获取

源站：https://doi.org/10.18710/TDJV8X

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数据说明

该数据集包含复现已发表结果所必需的变量。摘要：在2021年内，挪威计划完成对34-69岁女性采用基于HPV DNA的宫颈癌初筛，同时继续对25-33岁女性采用基于细胞学的筛查。近年来，40岁以下女性宫颈癌发病率增加了30%。在这一亚组女性中，近30%在癌症诊断前最近一次涂片检查结果为正常。这一观察结果要求对正常涂片进行质量控制。本研究旨在评估在一个筛查间隔内的队列设计中，对Pap涂片假阴性但3型（-16、-18、-45）HPV mRNA检测呈阳性的女性进行随访后，CIN2+项目敏感性的增加情况。研究队列包括521名年龄23-39岁、无CIN1+或HSIL既往史、涂片结果为ASC-US或更严重（ASC-US+）的女性，以及1444名筛查细胞学正常的女性。3型HPV mRNA的阳性率为1.9%（28/1444）。重新筛查发现23名女性为ASC-US，2名女性为LSIL，2名女性为ASC-H，1名女性为AGUS。

如果将复筛样本的HPV mRNA阳性率和组织学检查结果应用于所有细胞学检查正常的女性，估计可使CIN2+的筛查灵敏度提高16.4%（95% CI：15.3-17.5），CIN3+的筛查灵敏度提高17.3%（95% CI：16.2-18.4）。通过对不到2%的细胞学检查正常且3型HPV mRNA检测呈阳性的女性进行复筛，我们显著提高了筛查项目的灵敏度。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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