抗肿瘤中药肝肾归经与共享分子模块在卵巢癌、宫颈癌和膀胱癌中的处理数据与分析结果
补充表S0:肝肾中药-化合物二分网络中排名核心化合物(β-谷甾醇)的拓扑参数;补充表S1:与卵巢癌、膀胱癌和宫颈癌相关的化合物相关靶点和疾病相关靶点;补充表S2:靶点网络的Gene Ontology富集分析;补充表S3:靶点网络的KEGG通路富集分析

基本信息
资源简介
抗肿瘤中药肝肾归经与共享分子模块在卵巢癌、宫颈癌和膀胱癌中的处理数据与分析结果
该数据集为一项关于中药肝肾归经与抗肿瘤共享分子模块研究的配套数据与分析结果,聚焦卵巢癌、宫颈癌和膀胱癌三种妇科及泌尿系统肿瘤。数据集英文名称为“Processed data and analysis results for 'Deciphering Liver-Kidney Meridian Tropism and Shared Molecular Modules of Antitumor Herbal Medicines in Ovarian, Cervical, and Bladder Cancers'”,由Zhang, Sheng、Zhang, Tian和Zhu, Xiuxiu共同完成,发布于Zenodo平台,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议。数据集在本站归类于肿瘤/宫颈癌方向,来源站为doi.org。整体而言,该数据集围绕网络药理学分析流程,提供了从核心化合物拓扑参数、化合物与疾病靶点、基因本体富集到KEGG通路富集的系列补充表格,以及中药-归经关联和中药-癌症关联两个专门数据集,可用于支持中药抗肿瘤作用机制与归经理论的探索性研究。
【数据集背景】
该数据集服务于一项旨在解析中药肝肾归经与抗肿瘤共享分子模块的研究,研究对象涵盖卵巢癌、宫颈癌和膀胱癌。研究采用网络药理学思路,将中药、化合物、归经、靶点与疾病关联起来,试图从分子层面理解肝肾归经中药在多种肿瘤中的共同作用基础。数据集作为该研究的补充材料与配套数据,提供了分析过程中产生的拓扑参数、靶点集合、富集分析结果以及中药与归经、癌症之间的关联信息,便于读者复核研究结论或在此基础上开展二次分析。
【数据内容】
数据集包含多个组成部分。补充表S0记录了肝肾中药-化合物二分网络中排名核心化合物(β-谷甾醇)的拓扑参数。补充表S1列出了与卵巢癌、膀胱癌和宫颈癌相关的化合物相关靶点和疾病相关靶点。补充表S2为靶点网络的Gene Ontology富集分析结果。补充表S3为靶点网络的KEGG通路富集分析结果。此外,数据集还包含HerbMeriData,即用于网络药理学分析的肝肾归经相关化合物的中药-归经关联数据集;以及HerbCancerData,即中药-癌症关联数据集。上述内容共同构成了从化合物筛选、靶点识别到功能与通路注释的完整数据链条。
【采集与来源】
该数据集发布于Zenodo平台,来源站为doi.org。数据来源于一项关于中药肝肾归经与抗肿瘤共享分子模块的研究,具体采集方法、原始数据库、筛选标准及分析工具等信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于网络药理学、中药药理学及肿瘤学相关研究场景。研究者可利用补充表S0了解核心化合物在二分网络中的拓扑地位;利用补充表S1获取与卵巢癌、膀胱癌和宫颈癌相关的化合物靶点与疾病靶点,用于靶点重叠分析或网络构建;利用补充表S2和S3分别进行基因功能与信号通路的富集解读。HerbMeriData和HerbCancerData可用于中药-归经及中药-癌症关联的统计分析与可视化。整体上,该数据集适合作为中药抗肿瘤机制研究的参考数据,也可用于教学演示或方法学比较。
【使用方法】
使用者可根据研究目的选择相应文件。若关注核心化合物的网络地位,可查阅补充表S0中的拓扑参数;若需构建化合物-疾病靶点网络,可整合补充表S1中的靶点信息;若需进行功能与通路层面的解释,可分别使用补充表S2和补充表S3的富集结果。HerbMeriData和HerbCancerData可用于关联规则挖掘或网络可视化。使用时应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议的要求,规范引用。具体文件格式、字段结构及软件操作步骤源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于网络药理学分析流程产生,其质量取决于原始数据来源、靶点预测方法及富集分析参数等因素,这些细节源站未提供。数据集仅覆盖卵巢癌、宫颈癌和膀胱癌三种癌症类型,以及肝肾归经相关化合物,适用范围有限。补充表S0仅涉及β-谷甾醇这一核心化合物的拓扑参数,不代表全部化合物的网络特征。此外,网络药理学预测结果通常需要实验验证,该数据集未包含湿实验验证数据。使用者在解释结果时应结合具体研究背景,注意其探索性性质。
【引用与许可】
该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可协议,允许在署名的前提下共享、改编和商业使用。引用时应注明作者Zhang, Sheng、Zhang, Tian和Zhu, Xiuxiu,数据集名称,发布平台Zenodo,发布时间2026年,以及来源站doi.org。建议同时引用原研究论文,以完整反映数据来源与研究背景。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21729895
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 497.0 KB。
数据说明
补充表S0:肝-肾草药-化合物二分网络中排名靠前的核心化合物(β-谷甾醇)的拓扑参数;补充表S1:与卵巢癌、膀胱癌和宫颈癌相关的化合物相关靶点和疾病相关靶点;补充表S2:靶点网络的基因本体富集分析;补充表S3:靶点网络的KEGG通路富集分析。HerbMeriData:用于网络药理学分析的肝肾经络相关化合物的草药-经络关联数据集。HerbCancerData:草药-癌症关联数据集。
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