PRJNA450369:环境胁迫响应中的多层调控图谱
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA450369,主题为环境胁迫响应中的多层调控研究。BioProject 用于汇集来自单一机构或联盟的同一项研究计划所产生的多种生物数据类型,并为用户提供统一入口以查找该项目生成的不同类型数据

基本信息
资源简介
PRJNA450369:环境胁迫响应中的多层调控图谱
PRJNA450369 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究计划记录,其英文名称为“Mapping multi-layered regulation in response to environmental stress”,中文可理解为“环境胁迫响应中的多层调控图谱绘制”。该记录在本地分类中归入肿瘤 / 宫颈癌方向,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,主题标签为 Other。BioProject 的核心作用在于汇集来自单一机构或联盟的同一项研究计划所产生的多种生物数据类型,并为用户提供统一入口,以便查找该项目生成的不同类型数据。因此,PRJNA450369 可被视为一个围绕环境胁迫响应多层调控研究而组织的生物数据集合入口,而非单一类型的数据文件本身。
【数据集背景】
该数据集对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA450369,其主题为环境胁迫响应中的多层调控研究。BioProject 是 NCBI 提供的一种记录形式,用于将同一项研究计划所产生的生物数据集中呈现。根据源站描述,一个 BioProject 是一组与单一研究计划相关的生物数据,这些数据来自单一机构或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,用于查找该项目所生成的不同数据类型之间的链接。因此,PRJNA450369 的背景定位是一个研究计划级别的数据组织单元,其研究主题聚焦于环境胁迫条件下的多层调控机制。
【数据内容】
该数据集的主题为环境胁迫响应中的多层调控研究。BioProject 记录本身并不限定单一数据类型,而是用于汇集同一研究计划下产生的多种生物数据类型。源站描述指出,BioProject 记录提供用户一个统一入口,以查找该项目生成的不同类型数据。关于该数据集具体包含哪些样本、测序类型、组学层次或分析结果,源站未提供。本地分类将其归入肿瘤 / 宫颈癌方向,主题标签为 Other,但具体数据内容细节源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA450369。源站标题显示为“Mapping multi-layered regulation in response to en... (ID 450369) - BioProject - NCBI”。根据源站描述,BioProject 记录来源于单一机构或联盟的同一项研究计划。关于该项目的具体提交机构、联盟名称、样本采集方式、实验设计、测序平台或数据处理流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于需要查找或关联 PRJNA450369 这一研究计划所生成数据的场景。由于 BioProject 提供统一入口以链接同一项目下的多种数据类型,用户可将其作为检索起点,用于定位环境胁迫响应多层调控研究相关的生物数据。本地分类将其归入肿瘤 / 宫颈癌方向,因此也可能被用于该分类下的数据检索与组织。关于该数据集在具体研究分析、临床解读或方法开发中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以编号 PRJNA450369 或标题关键词进行检索,进入该记录页面。BioProject 记录提供指向该项目生成的不同类型数据的链接,用户可据此访问相关数据。关于具体的数据下载方式、访问权限、分析工具或使用步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录,其作用在于汇集同一研究计划下的多种生物数据类型并提供统一入口。源站描述未提供关于数据质量、完整性、准确性或技术限制的具体信息。关于样本量、数据覆盖度、潜在偏倚或使用限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,对应 NCBI BioProject 编号 PRJNA450369。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA450369
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们绘制了宫颈癌细胞在衣霉素处理下8小时时间过程中的转录本和蛋白质浓度图谱。我们通过核糖体和非核糖体蛋白的RNA足迹来补充这一数据集,以确定翻译和反式因子结合的变化。本研究的目标是揭示在内质网应激和氧化应激等不同应激条件下,转录和翻译水平上信号通路的时间依赖性复杂性。总体设计:将HeLa细胞置于内质网应激或氧化应激条件下。通过深度测序,在不同时间点(0、1、4和8小时)生成转录本、核糖体足迹和蛋白质占据图谱,一式三份,使用Illumina HiSeq 2500。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
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