phs000628:使用 NGS 表征转移性宫颈癌

数据以病例集形式提供,围绕使用 NGS 对转移性宫颈癌进行表征,可用于宫颈癌转移相关研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case Set
phs000628: Characterization of a Metastatic Cervical Cancer Using NGS

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

phs000628:使用 NGS 表征转移性宫颈癌

phs000628 是一个以病例集形式组织的数据集,英文全称为 Characterization of a Metastatic Cervical Cancer Using NGS,中文可理解为“利用新一代测序技术对转移性宫颈癌进行表征”。该数据集归属于肿瘤领域下的宫颈癌方向,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study(Case Set)。从整体定位来看,该数据集围绕转移性宫颈癌这一特定临床情形,借助 NGS(新一代测序)手段对相关样本展开表征研究,并以病例集的方式对外提供数据。对于关注宫颈癌转移机制、分子特征以及测序数据再利用的研究者而言,该数据集提供了一个以病例为单位的研究资源入口,其主题标签也明确指向“Case Set”这一组织形式。

【数据集背景】

宫颈癌是肿瘤研究中的重要方向之一,而转移性宫颈癌因其病情进展和分子层面的复杂性,往往是临床与基础研究关注的重点。该数据集正是在这一背景下产生,其英文名称直接点明了研究目标:使用 NGS 对转移性宫颈癌进行表征。数据集被归入肿瘤 / 宫颈癌分类,说明其研究对象和疾病领域均聚焦于宫颈癌,尤其是发生转移的情形。来源站 ncbi.nlm.nih.gov 将其标注为 dbGaP study(Case Set),表明它属于 dbGaP 体系下的研究条目,并以病例集的形式存在。关于该研究的具体发起机构、研究周期、样本收集地点等更详细的背景信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集以病例集(Case Set)的形式提供数据,主题标签同样为 Case Set。其核心内容围绕“使用 NGS 对转移性宫颈癌进行表征”展开,意味着数据与新一代测序相关,并服务于转移性宫颈癌的分子表征。数据集的英文名称中“Characterization of a Metastatic Cervical Cancer Using NGS”已经概括了其内容方向,即针对转移性宫颈癌的 NGS 表征。关于具体的测序平台、测序深度、样本数量、变异类型、数据文件格式、数据量大小等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study(Case Set)。dbGaP 是 NCBI 下属的基因型与表型数据库,通常用于存储和研究基因型与表型之间的关联数据。该数据集以病例集形式组织,说明其数据采集围绕病例展开。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息、纳入与排除标准等,源站未提供。

【适用场景】

根据其主题和描述,该数据集可用于宫颈癌转移相关研究。具体而言,围绕使用 NGS 对转移性宫颈癌进行表征这一目标,数据可支持对转移性宫颈癌分子特征的分析与探索。由于数据以病例集形式提供,适合以病例为基础的研究设计。关于更细化的适用场景,如特定突变分析、通路研究、疗效关联分析等,源站未提供。

【使用方法】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP study(Case Set)。通常,dbGaP 数据的使用需要遵循其数据访问流程和授权机制。关于该数据集的具体下载方式、访问权限申请步骤、所需工具或分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被源站描述为 dbGaP study(Case Set),并以病例集形式提供。关于数据质量评估指标、样本量大小、是否存在批次效应、数据完整性、覆盖度、重复性等质量相关信息,以及使用该数据集时可能面临的限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP study(Case Set)。关于该数据集的具体引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及是否需要获得额外授权等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000628

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set).

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