HPV6或HPV16的E6和E7基因及LXSN空载体转导人包皮角质形成细胞的microRNA表达谱
数据为转导携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的人包皮角质形成细胞(HFKs)的microRNA表达谱

基本信息
资源简介
HPV6或HPV16的E6和E7基因及LXSN空载体转导人包皮角质形成细胞的microRNA表达谱
该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/宫颈癌分类,主题为Transcriptomics。数据为转导携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的人包皮角质形成细胞(HFKs)的microRNA表达谱。源站描述指出,宫颈癌几乎均与HPV感染相关,E6和E7基因可延迟角质形成细胞分化并刺激细胞周期进展,其部分致癌特性由宿主microRNA介导。该数据通过miRNA微阵列分析获得,可用于识别全基因组miRNA表达变化,并用于后续鉴定与研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):宫颈癌是全球女性癌症相关死亡的主要原因之一。几乎所有宫颈癌病例都归因于人类乳头瘤病毒(HPV)感染,主要是高危型HPV16和HPV18。两个病毒基因E6和E7在病毒生命周期中发挥重要作用,因为它们延迟角质形成细胞分化并刺激细胞周期进展,使病毒能够利用宿主DNA复制机制来复制其基因组。E6和E7的部分致癌特性由参与控制细胞增殖、衰老和凋亡的宿主microRNA(miRNA)介导。为了识别miRNA表达谱的全基因组变化,对转导了携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的人包皮角质形成细胞(HFKs)进行了miRNA微阵列分析。该数据集用于识别并进一步
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6360
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6360
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
宫颈癌是全球女性癌症相关死亡的主要原因之一。几乎所有宫颈癌病例都归因于人乳头瘤病毒(HPV)感染,主要是高危型HPV16和HPV18。两个病毒基因E6和E7在病毒生命周期中发挥重要作用,因为它们延迟角质形成细胞分化并刺激细胞周期进程,使病毒能够利用宿主DNA复制机制来复制其基因组。E6和E7的某些致癌特性是由参与控制细胞增殖、衰老和凋亡的宿主微小RNA(miRNA)介导的。为了鉴定miRNA表达谱的全基因组变化,对转导了携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的HFK进行了miRNA微阵列分析。该数据集用于鉴定并进一步研究miR-146a-5p在宫颈癌中的作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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