HPV6或HPV16的E6和E7基因及LXSN空载体转导人包皮角质形成细胞的microRNA表达谱

数据为转导携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的人包皮角质形成细胞(HFKs)的microRNA表达谱

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
MicroRNA expression profile in human foreskin keratinocytes (HFKs) transduced with retroviral vectors carrying E6 and E7 genes of either HPV6 or HPV16 and with the LXSN empty vector

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

HPV6或HPV16的E6和E7基因及LXSN空载体转导人包皮角质形成细胞的microRNA表达谱

该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/宫颈癌分类,主题为Transcriptomics。数据为转导携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的人包皮角质形成细胞(HFKs)的microRNA表达谱。源站描述指出,宫颈癌几乎均与HPV感染相关,E6和E7基因可延迟角质形成细胞分化并刺激细胞周期进展,其部分致癌特性由宿主microRNA介导。该数据通过miRNA微阵列分析获得,可用于识别全基因组miRNA表达变化,并用于后续鉴定与研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):宫颈癌是全球女性癌症相关死亡的主要原因之一。几乎所有宫颈癌病例都归因于人类乳头瘤病毒(HPV)感染,主要是高危型HPV16和HPV18。两个病毒基因E6和E7在病毒生命周期中发挥重要作用,因为它们延迟角质形成细胞分化并刺激细胞周期进展,使病毒能够利用宿主DNA复制机制来复制其基因组。E6和E7的部分致癌特性由参与控制细胞增殖、衰老和凋亡的宿主microRNA(miRNA)介导。为了识别miRNA表达谱的全基因组变化,对转导了携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的人包皮角质形成细胞(HFKs)进行了miRNA微阵列分析。该数据集用于识别并进一步

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/宫颈癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6360

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

宫颈癌是全球女性癌症相关死亡的主要原因之一。几乎所有宫颈癌病例都归因于人乳头瘤病毒(HPV)感染,主要是高危型HPV16和HPV18。两个病毒基因E6和E7在病毒生命周期中发挥重要作用,因为它们延迟角质形成细胞分化并刺激细胞周期进程,使病毒能够利用宿主DNA复制机制来复制其基因组。E6和E7的某些致癌特性是由参与控制细胞增殖、衰老和凋亡的宿主微小RNA(miRNA)介导的。为了鉴定miRNA表达谱的全基因组变化,对转导了携带HPV6或HPV16的E6和E7基因的逆转录病毒载体以及LXSN空载体的HFK进行了miRNA微阵列分析。该数据集用于鉴定并进一步研究miR-146a-5p在宫颈癌中的作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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