宫颈癌3p11-p14启动子甲基化与染色体缺失在基因沉默中的相互作用
该数据集来自omicsdi.org，聚焦宫颈癌中3p11-p14区域启动子甲基化与染色体缺失在基因沉默中的相互作用。研究整合了甲基化、基因剂量与表达谱数据，通过比较肿瘤与正常宫颈组织的CpG位点甲基化水平，识别出26个高甲基化基因，并基于甲基化与表达的相关性提出候选调控基因
基本信息
资源简介
宫颈癌3p11-p14启动子甲基化与染色体缺失在基因沉默中的相互作用
该数据集来自omicsdi.org，聚焦宫颈癌中3p11-p14区域启动子甲基化与染色体缺失在基因沉默中的相互作用。研究整合了甲基化、基因剂量与表达谱数据，通过比较肿瘤与正常宫颈组织的CpG位点甲基化水平，识别出26个高甲基化基因，并基于甲基化与表达的相关性提出候选调控基因。整合分析揭示了涵盖8个高甲基化基因的三种显著调控模式。数据可用于探索宫颈癌中甲基化与基因剂量协同调控基因表达的机制（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们进行了整合的甲基化、基因剂量和表达谱分析，以探究宫颈癌3p11-p14区域启动子甲基化与缺失在基因沉默中的相互作用。通过比较单个CpG位点的甲基化水平与正常宫颈组织的相应数据，共鉴定出26个高甲基化基因。基于甲基化与基因表达之间的相关性，提出了肿瘤中候选的甲基化调控基因。对甲基化、基因剂量和表达的整合分析揭示了涵盖8个高甲基化基因的三种显著调控模式：甲基化驱动模式、基因剂量驱动模式以及甲基化和基因剂量联合驱动模式。对于LRIG1基因，同时具有高甲基化和缺失的患者与仅具有高甲基化或无这些事件的患者相比，预后更差。C3or
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-68339
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-68339
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们进行了整合的甲基化、基因剂量和表达谱分析，以探索宫颈癌中3p11-p14区域启动子甲基化与基因缺失在基因沉默中的相互作用。通过比较单个CpG位点的甲基化水平与正常宫颈组织的相应数据，共鉴定出26个高甲基化基因。根据甲基化与基因表达之间的相关性，提出了肿瘤中候选的甲基化调控基因。对甲基化、基因剂量和表达的综合分析揭示了涵盖8个高甲基化基因的三种显著调控模式：甲基化驱动模式、基因剂量驱动模式以及甲基化和基因剂量联合驱动模式。对于LRIG1基因，同时具有高甲基化和基因缺失的患者与仅具有高甲基化或无上述事件的患者相比，预后更差。C3orf14作为一个新的甲基化调控的抑癌基因出现，研究发现其敲低可促进人乳头瘤病毒（HPV）转化的角质形成细胞的侵袭性生长。
在队列1中，Illumina 450K甲基化芯片的甲基化水平与Illumina基因表达数据进行了相关性分析，并在队列2中进行了验证。
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