宿主基因组甲基化：肛门癌检测的筛查工具

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06792604

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：肛门癌。一、关于病理学的当前知识状况 2020年，全球报告了30，000例肛门鳞状细胞癌病例。这些癌症在女性中占2/3。在一般人群中相当罕见，男性年龄标准化发病率为每10万人年0.35例，女性为0.57例。感染HIV的男男性行为者（MSM）人群患肛门癌的风险更高：2012年的研究报告称，与非HIV感染的男性人群相比，相对风险增加了80倍。该人群也更易暴露于肛门HPV感染，这加剧了与HIV感染相关的免疫功能障碍。因此，该人群早已成为基于细胞学检查的肛管癌筛查具体建议的对象。最近的一项荟萃分析对不同人群的肛门癌风险进行了分层。它证实了感染HIV的MSM人群中肛门癌的超额风险（在45岁以上的感染HIV的MSM中高达每10万人年100例）。它还确定了其他有肛门癌风险的人群。

已经明确的是，曾患宫颈癌或外阴阴道癌的女性中，肛门癌的发病率较高。但Clifford等人的这项荟萃分析显示，根据既往HPV诱导癌症类型的不同，肛门癌风险的分层也有所不同。因此，有外阴癌病史者肛门癌发病率最高，为每10万人年50例，而有阴道癌或宫颈癌病史者则接近每10万人年10例。另一个肛门癌风险群体由未感染HIV的免疫抑制人群组成，尤其是实体器官移植受者，其肛门癌发病率因移植类型不同而异，最重要的是取决于移植后的时间。总体而言，无论性别，高收入国家的肛门癌发病率均较高。2018年，新增肛门癌病例1，532例

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。