冷冻化处理和通道依赖性恢复下HeLa细胞的RNA序列分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336961

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究采用RNA测序技术，探究HeLa细胞在冷冻硅化处理（Si20和Si30）条件下及未处理对照组中的转录变化。分别在早期响应阶段（P0，0 h和6 h）及传代依赖的恢复过程（P1–P3）中对细胞进行表达谱分析。通过差异基因表达与通路分析，表征细胞对冷冻硅化的响应，并评估转录变化在细胞传代过程中的持续性。所有样本均使用Illumina NovaSeq平台（NovaSeq 6000和NovaSeq X Plus）进行测序，并提供原始测序数据及处理后表达矩阵。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。