粪肠球菌上清处理HeLa细胞的转录组分析：RNA-seq揭示差异基因表达
该数据集来自NCBI GEO，包含经粪肠球菌上清（相当于1×10⁸ CFU/mL）处理24小时的HeLa细胞转录组测序数据，设对照组和处理组各三个生物学重复
基本信息
资源简介
粪肠球菌上清处理HeLa细胞的转录组分析：RNA-seq揭示差异基因表达
Transcriptomic Analysis of HeLa Cells Treated with Enterococcus faecium Supernatant: RNA-seq Reveals Differential Gene Expression
该数据集来自NCBI GEO，包含经粪肠球菌上清（相当于1×10⁸ CFU/mL）处理24小时的HeLa细胞转录组测序数据，设对照组和处理组各三个生物学重复。数据可用于分析粪肠球菌代谢物对宫颈癌细胞转录谱的影响，识别涉及细胞代谢、应激反应和关键信号通路的差异表达基因，为宿主-细菌代谢互作的分子机制研究提供基础（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jan 09 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究旨在探究人宫颈癌HeLa细胞对粪肠球菌来源代谢物的转录响应。HeLa细胞用过滤除菌的粪肠球菌上清（相当于1×10⁸ CFU/mL）处理24小时，对照组（HC）和处理组（HT）各设三个生物学重复。提取总RNA并进行转录组测序。生物信息学分析鉴定出一组参与细胞代谢、应激反应和关键信号通路的差异表达基因。结果表明，粪肠球菌代谢物显著改变HeLa细胞的转录谱，为宿主-细菌代谢互作的分子机制提供了新见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316117
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 18 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316117
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在探究人宫颈癌HeLa细胞对屎肠球菌来源代谢物的转录响应。用经滤器除菌的屎肠球菌上清液（相当于1×10⁸ CFU/mL）处理HeLa细胞24小时，对照组（HC）和处理组（HT）各设三个生物学重复。提取总RNA并进行转录组测序。生物信息学分析鉴定出一组参与细胞代谢、应激反应及关键信号通路的差异表达基因。结果表明，屎肠球菌代谢物显著改变了HeLa细胞的转录谱，为宿主–细菌代谢相互作用的分子机制提供了新的见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
