C16orf87蛋白作为MIER核心pressor复合物亚基调控胚胎发育与细胞迁移
数据涉及C16orf87作为MIER核心pressor复合物亚基的功能研究,通过CRISPR/Cas9基因组编辑揭示其缺失影响染色质可及性、降低细胞迁移并损害斑马鱼胚胎发育

基本信息
资源简介
C16orf87蛋白作为MIER核心pressor复合物亚基调控胚胎发育与细胞迁移
The C16orf87 protein is a subunit of the MIER corepressor complex controlling embryonic development and cell migration
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE308337_series_matrix.txt.gz),主题为肿瘤/宫颈癌,采用Genome binding/occupancy profiling by high throughput sequencing技术,物种为9606(人类)。数据涉及C16orf87作为MIER核心pressor复合物亚基的功能研究,通过CRISPR/Cas9基因组编辑揭示其缺失影响染色质可及性、降低细胞迁移并损害斑马鱼胚胎发育。可用于研究HDAC1与MIER1蛋白相互作用及基因表达调控机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 17 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):组蛋白去乙酰化酶(HDACs)对组蛋白的修饰对于控制染色质结构和调节基因表达至关重要。在功能上,HDACs作为多种多亚基核心pressor复合物中的酶亚基,从而靶向不同的基因集。在这里,我们将C16orf87鉴定为MIER核心pressor复合物的一个先前未表征的功能亚基,该复合物介导HDAC1和MIER1蛋白相互作用。利用CRISPR/Cas9基因组编辑,我们证明人类细胞中C16orf87的缺失会改变染色质可及性、减少细胞迁移并损害斑马鱼的健康胚胎发育。基于这些发现,我们建议将C16orf87重命名为HDAC相互作用蛋白(HDIP),以反映其新揭示的功能。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL30173、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308337
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 06 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)对组蛋白的修饰对于控制染色质结构和调控基因表达至关重要。在功能上,HDACs作为多种多亚基辅阻遏物复合体中的酶亚基,从而靶向不同的基因集。在此,我们鉴定出C16orf87是MIER辅阻遏物复合体中一个先前未表征的功能性亚基,该亚基介导HDAC1与MIER1蛋白之间的相互作用。利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术,我们证明在人细胞中C16orf87的缺失会改变染色质可及性、减少细胞迁移,并损害斑马鱼的健康胚胎发育。基于这些发现,我们建议将C16orf87重命名为HDAC相互作用蛋白(HDIP),以反映其新揭示的功能。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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