GSE305052:火炭母来源miR319a靶向ITGA3跨物种抑制宫颈癌
数据采用高通量测序分析火炭母miRNA表达谱,共鉴定673个miRNA,包括422个该植物特有新miRNA和251个保守miRNA,其中pch-miR319a丰度最高,并可在子宫和肿瘤中富集,具有癌症相关通路靶基因谱和跨物种调控潜力

基本信息
资源简介
GSE305052:火炭母来源miR319a靶向ITGA3跨物种抑制宫颈癌
Distinct miR319a identified from Persicaria chinensis mediates cross-kingdom suppression of cervical cancer by targeting ITGA3
该数据集来自NCBI GEO,标题为GSE305052,聚焦火炭母(Persicaria chinensis)来源的miR319a通过靶向ITGA3跨物种抑制宫颈癌的研究。数据采用高通量测序分析火炭母miRNA表达谱,共鉴定673个miRNA,包括422个该植物特有新miRNA和251个保守miRNA,其中pch-miR319a丰度最高,并可在子宫和肿瘤中富集,具有癌症相关通路靶基因谱和跨物种调控潜力。数据含1个文件,可用于非编码RNA表达谱分析与跨物种调控预测研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):火炭母(Persicaria chinensis)是一种著名的药食两用传统中草药,其抗炎、抗氧化和抗肿瘤等治疗作用已被广泛认可。然而,来自该植物的miRNA在人类疾病跨物种调控中的作用尚未被研究。在本研究中,我们利用高通量测序分析火炭母的miRNA表达谱,共鉴定出673个miRNA,包括422个该植物特有的新miRNA和251个保守miRNA。在保守miRNA中,pch-miR319a被发现丰度最高。此外,食物来源的pch-miR319a在子宫和肿瘤中积累,并在癌症相关通路中拥有丰富的靶基因谱,展现出显著的跨物种调控潜力。利用双荧光素酶报告
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE305052
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 18 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
火炭母(Persicaria chinensis)是一种著名的药食两用传统中草药,其抗炎、抗氧化和抗肿瘤等治疗作用已被广泛认可。然而,该植物来源的miRNA在跨 kingdom 调控人类疾病中的作用尚未被研究。本研究采用高通量测序技术分析火炭母的miRNA表达谱,共鉴定出673个miRNA,包括422个该植物特有的新miRNA和251个保守miRNA。在保守miRNA中,pch-miR319a丰度最高。此外,食源性的pch-miR319a可在子宫和肿瘤中蓄积,并在癌症相关通路中拥有丰富的靶基因资源,展现出显著的跨 kingdom 调控潜力。利用双荧光素酶报告基因实验,我们证实火炭母来源的pch-miR319a靶向与宫颈癌进展相关的Itga3基因。过表达pch-miR319a可显著降低HeLa宫颈癌细胞的体外活力、迁移能力并诱导其凋亡。
此外,在宫颈癌的同系小鼠肿瘤模型中,pch-miR319a治疗有效抑制肿瘤生长,并下调ITGA3及增殖标志物Ki-67的表达。我们的研究凸显了来源于P. chinensis的pch-miR319a作为靶向ITGA3的宫颈癌新型治疗药物的潜力,并为植物miRNA在人类疾病中的跨界调控机制提供了新见解。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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