GSE295262:KCTD10 是同向转录-复制冲突的传感器
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 KCTD10 是同向转录-复制冲突的传感器,属于肿瘤/宫颈癌分类。源站描述指出 CUL3-KCTD10 E3 连接酶感知转录-复制冲突并促进 RNA 聚合酶复合物重塑以允许复制体绕过

基本信息
资源简介
GSE295262:KCTD10 是同向转录-复制冲突的传感器
KCTD10 is a sensor for co-directional transcription-replication conflicts
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 KCTD10 是同向转录-复制冲突的传感器,属于肿瘤/宫颈癌分类。数据为高通量测序的基因组结合/占据谱,包含 1 个文件(GSE295262_series_matrix.txt.gz),物种为人类(9606),平台为 GPL34284。源站描述指出 CUL3-KCTD10 E3 连接酶感知转录-复制冲突并促进 RNA 聚合酶复合物重塑以允许复制体绕过。该数据可用于研究 KCTD10 在转录-复制冲突感知及基因组稳定性维持中的作用(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 22 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在 DNA 复制过程中,复制体必须清除包括转录机器在内的障碍和路障。当复制体与转录机器发生碰撞时,就会产生转录-复制冲突(TRCs),这日益被认为是哺乳动物基因组不稳定的重要来源。细胞如何促进复制体在 TRCs 位点绕过尚不完全清楚。在这里,我们表明 CUL3-KCTD10 E3 连接酶感知 TRCs,并促进 RNA 聚合酶复合物的重塑以允许复制体绕过。我们发现,底物衔接蛋白 KCTD10 与复制体和转录机器相互作用,并在无应激条件下调节两者。这些双价相互作用使 KCTD10 能够检测同向 TRCs,并促进 KCTD10 复合物的高阶组装,从而招募 CUL3 以诱导 RNA 聚合酶的泛素化和去除。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34284、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE295262
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 30 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
在DNA复制过程中,复制体必须清除包括转录机器在内的障碍和路障。当复制体与转录机器发生碰撞时,即产生转录-复制冲突(TRCs),这日益被认为是哺乳动物基因组不稳定的重要来源。细胞如何促进复制体在TRCs位点实现旁路尚不完全清楚。本研究表明,CUL3-KCTD10 E3连接酶能够感知TRCs并促进RNA聚合酶复合物的重塑,从而允许复制体旁路。我们发现,底物衔接蛋白KCTD10与复制体和转录机器相互作用,并在无应激条件下对二者进行调控。这些双价相互作用使KCTD10能够检测同向TRCs,并促进KCTD10复合物的高级组装,进而招募CUL3诱导RNA聚合酶因子TCEA2的泛素化与清除。在缺乏KCTD10的情况下,TCEA2和RNA聚合酶复合物的滞留增加,导致TRCs积累和DNA损伤加剧。
我们的结果展示了复制如何通过转录活跃区域进行,利用CUL3-KCTD10复合体的独特桥接功能。这些发现为转录与复制之间的协调如何有助于维持基因组稳定性提供了一个框架。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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