GFRA1表观遗传沉默通过SERPINE1促进宫颈癌转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE292433

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

宫颈癌（CC）是全球女性中第四大常见恶性肿瘤。癌基因/抑癌基因的异常甲基化可导致宫颈癌的发生和进展。在本研究中，我们鉴定出GFRA1是宫颈癌中一个异常甲基化的基因，其表达水平与启动子甲基化呈负相关。在宫颈癌细胞系和肿瘤组织中一致观察到GFRA1启动子高甲基化，且与正常对照相比其表达显著降低。功能实验表明，GFRA1过表达在体外抑制宫颈癌细胞迁移，并在体内抑制肺转移形成。整合RNA-Seq和网络分析揭示SERPINE1是关键下游效应因子，其过表达在体外和体内均增强了宫颈癌细胞的迁移能力。总之，本研究揭示GFRA1启动子高甲基化沉默其表达，通过SERPINE1促进宫颈癌转移。

因此，我们的发现有助于理解GFRA1甲基化在宫颈癌中的潜在作用，并可能作为宫颈癌潜在的诊断和治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。