GSE281857:VRK1 可作为子宫颈小细胞神经内分泌癌的新治疗靶点
该数据集来自 NCBI GEO(GSE281857),聚焦子宫颈小细胞神经内分泌癌(SCNEC)中 VRK1 作为治疗靶点的研究

基本信息
资源简介
GSE281857:VRK1 可作为子宫颈小细胞神经内分泌癌的新治疗靶点
VRK1 can be a novel therapeutic target in small cell neuroendocrine carcinoma of the uterine cervix
该数据集来自 NCBI GEO(GSE281857),聚焦子宫颈小细胞神经内分泌癌(SCNEC)中 VRK1 作为治疗靶点的研究。数据为高通量测序表达谱,包含 1 个文件(GSE281857_series_matrix.txt.gz),平台为 GPL24676,物种为人(9606)。源站描述显示 VRK1 在 SCNEC 中表达高于其他宫颈癌组织学类型,shRNA 敲低 VRK1 在 3D 培养和皮下小鼠模型中均表现出抗肿瘤效果,RNA-seq 分析提示其作用与外部刺激响应和线粒体通路相关。该数据可用于探索 VRK1 在 SCNEC 中的功能机制及候选治疗靶点研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 14 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):子宫颈小细胞神经内分泌癌(SCNEC)是一种罕见且高度侵袭性的癌症。在本研究中,我们旨在探究疫苗相关激酶1(VRK1)作为 SCNEC 治疗靶点的潜力,并阐明其功能机制。研究发现,VRK1 在 SCNEC 中的表达高于其他组织学类型的宫颈癌。在 3D 细胞培养和皮下小鼠模型中,shRNA 介导的 VRK1 敲低(shVRK1)均表现出显著的抗肿瘤效果。对皮下小鼠模型 RNA-seq 数据的基因集富集分析表明,VRK1 的作用与对外部刺激的反应和线粒体通路相关。在体外,与对照相比,shVRK1 细胞在过氧化氢刺激下线粒体膜电位显著降低,提示 VRK1 敲低诱导线粒体功能障
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE281857
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 14 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
子宫颈小细胞神经内分泌癌(SCNEC)是一种罕见且高度侵袭性的癌症。本研究旨在探讨痘苗病毒相关激酶1(VRK1)作为SCNEC治疗靶点的潜力,并阐明其功能机制。研究发现,VRK1在SCNEC中的表达高于其他组织学类型的宫颈癌。在3D细胞培养和皮下小鼠模型中,shRNA介导的VRK1敲低(shVRK1)均表现出显著的抗肿瘤效果。对皮下小鼠模型RNA-seq数据的基因集富集分析表明,VRK1的作用与对外部刺激的反应及线粒体通路相关。在体外实验中,与对照组相比,shVRK1细胞在过氧化氢刺激下线粒体膜电位显著降低,提示VRK1敲低可在外部刺激下诱导线粒体功能障碍。综上所述,VRK1可能是SCNEC一个有前景的治疗靶点,尤其是通过其在线粒体对外部刺激反应中的作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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