siRMSD参数预测siRNA脱靶效应数据集(2/2)
该数据集来自NCBI GEO,包含HeLa细胞转染不同2'-化学修饰siRNA后的全基因组基因表达谱,用于研究化学修饰引起的结构扭曲参数siRMSD与siRNA脱靶效应的关系

基本信息
资源简介
siRMSD参数预测siRNA脱靶效应数据集(2/2)
An siRMSD parameter of structural distortion induced by chemical modification is predictive of the off-target effect of siRNA_(2/2)
该数据集来自NCBI GEO,包含HeLa细胞转染不同2'-化学修饰siRNA后的全基因组基因表达谱,用于研究化学修饰引起的结构扭曲参数siRMSD与siRNA脱靶效应的关系。数据覆盖肿瘤/宫颈癌方向,文件为GSE278439_series_matrix.txt.gz,可用来分析修饰对基因表达的影响并预测脱靶效应(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Sep 30 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):为了研究具有各种2'-修饰的siRNA对全基因组脱靶效应的影响,我们分析了转染其siRNA的HeLa细胞的基因表达谱。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL20844、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278439
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 26 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278439
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为研究带有不同2’-修饰的siRNA对全基因组脱靶效应的影响,我们分析了转染相应siRNA的HeLa细胞的基因表达谱。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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