宫颈癌细胞3D与2D培养体系转录组差异数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含SiHa宫颈癌细胞在3D与2D培养体系下的RNA测序转录组数据,用于比较两种培养条件下的基因表达差异

基本信息
资源简介
宫颈癌细胞3D与2D培养体系转录组差异数据集
Deciphering the Divergent Transcriptomic Landscapes of Cervical Cancer Cells Grown in 3D and 2D Cell Culture Systems
该数据集来自NCBI GEO,包含SiHa宫颈癌细胞在3D与2D培养体系下的RNA测序转录组数据,用于比较两种培养条件下的基因表达差异。数据覆盖宫颈癌细胞在三维与二维环境中的转录组景观,可支撑肿瘤微环境模拟、细胞增殖与分化相关基因表达研究,以及3D培养模型与2D模型的转录组特征分类分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 24 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):宫颈癌仍是全球女性面临的重大健康挑战,对撒哈拉以南非洲等发展中地区的影响尤为严重。利用近期在开发合适临床前模型以研究细胞增殖、分化和基因表达方面的进展,我们使用RNA测序比较了在3D与2D培养体系中生长的SiHa宫颈癌细胞的转录组谱。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270674
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 13 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
宫颈癌仍然是全球女性面临的重大健康挑战,对撒哈拉以南非洲等发展中地区的影响尤为严重。利用近期在开发合适的临床前模型以研究细胞增殖、分化和基因表达方面取得的进展,我们采用RNA测序技术,比较了在3D与2D培养系统中生长的SiHa宫颈癌细胞的转录组图谱。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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