Hippo通路转录因子YAP和TAZ在宫颈癌中的HPV型别依赖作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261673

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

人乳头瘤病毒（HPVs）导致大多数宫颈癌以及越来越多的其他肛门生殖器癌和口腔癌，其中大多数病例由HPV16或HPV18引起。HPV劫持宿主信号通路以促进增殖、驱动癌变。理解这些相互作用有助于鉴定HPV驱动恶性肿瘤所亟需的治疗方法。Hippo信号通路在HPV阳性癌症中具有重要作用，其下游效应分子YAP发挥促癌作用。然而，其旁系同源物TAZ在这些癌症中的意义在很大程度上尚未被阐明。我们证明，TAZ以HPV型别依赖的方式发生失调，其机制与YAP不同，并通过替代性细胞靶点控制增殖。对宫颈癌细胞系和患者活检组织的分析显示，TAZ表达仅在HPV18阳性和HPV18样细胞中显著升高。仅在HPV18阳性细胞中，敲低TAZ可降低增殖、迁移和侵袭。对HPV18阳性宫颈细胞的RNA测序显示，YAP和TAZ具有不同的靶点，提示它们促进不同的机制。因此，在HPV18阳性癌症中，YAP和TAZ发挥非冗余的作用。

该分析将TOGARAM2鉴定为一个此前未被表征的TAZ靶点，并证明其在HPV18+癌症中作为TAZ介导的增殖、迁移和侵袭的关键效应因子发挥作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。