整合应激反应微调18S非功能性rRNA降解

该数据集为GSE255784 SuperSeries,标题为整合应激反应微调18S非功能性rRNA降解,来源为NCBI。本站分类为肿瘤/宫颈癌,包含1个文件(GSE255784_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱分析,物种为9606(人类),平台为GPL3088

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基因组GPL308829606
GSE255784: The integrated stress response finetunes 18S nonfunctional rRNA decay

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

整合应激反应微调18S非功能性rRNA降解

GSE255784 是一个来自 NCBI 的 SuperSeries 数据集,标题为“整合应激反应微调 18S 非功能性 rRNA 降解”(The integrated stress response finetunes 18S nonfunctional rRNA decay)。该数据集在本站被归类为肿瘤 / 宫颈癌方向,主题涉及高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL30882。数据集由 Colin、Wu 提交,发布时间为 Feb 14 202,包含 1 个文件,即 GSE255784_series_matrix.txt.gz。作为 SuperSeries,其源站描述说明它由下方列出的若干 SubSeries 组成,适合作为研究整合应激反应与 18S 非功能性 rRNA 降解关系的表达谱数据入口。

【数据集背景】

该数据集围绕整合应激反应(integrated stress response)对 18S 非功能性 rRNA 降解(18S nonfunctional rRNA decay)的微调作用展开。源站标题直接反映了这一研究主题。数据集以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出其由下方列出的 SubSeries 组成,说明该 SuperSeries 用于整合多个子系列的数据资源。本站将其归入肿瘤 / 宫颈癌分类,主题标签涉及高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL30882。作者为 Colin、Wu,发布时间为 Feb 14 202。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE255784_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,属于系列矩阵文件,通常用于承载表达谱数据的样本与特征信息。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL30882 和 9606,分别对应高通量测序表达谱分析、平台编号与人类物种。数据集本身为 SuperSeries,源站描述说明其由下方列出的 SubSeries 组成,但具体子系列的数量与内容源站未提供。文件数量为 1,表明当前可获取的数据文件即为该系列矩阵压缩包。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI。数据集英文名为 GSE255784: The integrated stress response finetunes 18S nonfunctional rRNA decay,源站标题与英文名一致。作者为 Colin、Wu,发布时间为 Feb 14 202。平台信息为 GPL30882,物种为 9606(人类)。本站分类为肿瘤 / 宫颈癌。关于样本采集的具体组织类型、处理条件、测序策略细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与整合应激反应、18S 非功能性 rRNA 降解相关的表达谱分析研究,也可作为肿瘤 / 宫颈癌方向的高通量测序表达谱数据资源使用。由于主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing,适合用于基因表达层面的比较与探索。作为 SuperSeries,它可用于整合其下属 SubSeries 的数据入口。具体适用分析类型与实验设计匹配度,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE255784_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于文件为系列矩阵格式,读取时需关注样本信息与表达值字段的组织方式。关于平台注释文件、子系列文件的具体获取与整合方式,源站未提供。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE255784_series_matrix.txt.gz。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供子系列清单、样本数量、测序深度、质控指标等信息。本站分类为肿瘤 / 宫颈癌,但数据集主题聚焦于整合应激反应与 18S 非功能性 rRNA 降解,具体与宫颈癌的关联细节源站未提供。发布时间为 Feb 14 202,年份信息不完整。使用前应自行核对文件字段与编码。

【引用与许可】

作者为 Colin、Wu,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。引用时应参考源站标题“The integrated stress response finetunes 18S nonfunctional rRNA decay”及数据集编号 GSE255784。关于许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE255784

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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