GSE249929：整合的HPV18作为类增强子RNA并形成相分离凝聚体促进致癌基因表达

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE249929

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数据说明

大多数宫颈癌由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起。已知在HeLa细胞中，HPV18病毒基因组整合于染色体8q24.21位点，并激活原癌基因c-Myc的转录。然而，整合的HPV片段如何发挥转录激活功能的机制尚未完全阐明。本研究发现，HPV18转录本本身具有类似增强子RNA的功能，可激活其邻近基因，包括CCAT1-5L和c-Myc。我们证明，整合入人类基因组的HPV18基因受转录共调节因子BRD4和Mediator的激活。转录产生的HPV18 RNA在染色体8q24.21位点形成液态凝聚体，进而募集RNA聚合酶II。此外，我们鉴定出来自CCAT1-5L上游区域的一个未表征转录本，命名为URC。URC RNA与HPV18转录形成嵌合RNA，由HPV18转录本的3‘-非翻译区组成。我们发现，URC通过为HPV18转录本提供多腺苷酸化位点，有助于HPV18 RNA的稳定。

我们的研究结果表明，HPV18在8q24.21位点的整合导致HPV18-URC嵌合RNA的形成，并通过基于RNA的液滴形成促进肿瘤发生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。